data_Q1O
# 
_chem_comp.id                                    Q1O 
_chem_comp.name                                  "[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-[4-[(1~{S})-1-[methyl-[2,2,2-tris(fluoranyl)ethylcarbamoyl]amino]ethyl]pyridin-1-yl]-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl hydrogen phosphate" 
_chem_comp.type                                  non-polymer 
_chem_comp.pdbx_type                             HETAIN 
_chem_comp.formula                               "C26 H36 F3 N8 O15 P2" 
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_chem_comp.pdbx_initial_date                     2022-05-31 
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_chem_comp.pdbx_release_status                   REL 
_chem_comp.pdbx_replaced_by                      ? 
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_chem_comp.three_letter_code                     Q1O 
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_chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag   N 
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details        Corina 
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag   N 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code        8D0H 
_chem_comp.pdbx_subcomponent_list                ? 
_chem_comp.pdbx_processing_site                  RCSB 
# 
loop_
_chem_comp_atom.comp_id 
_chem_comp_atom.atom_id 
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_chem_comp_atom.type_symbol 
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_chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag 
_chem_comp_atom.pdbx_stereo_config 
_chem_comp_atom.model_Cartn_x 
_chem_comp_atom.model_Cartn_y 
_chem_comp_atom.model_Cartn_z 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id 
_chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id 
_chem_comp_atom.pdbx_ordinal 
Q1O O10 O1  O 0 1 N N N 17.597 10.363 5.052 2.113   2.751  0.989  O10 Q1O 1  
Q1O C02 C1  C 0 1 N N R 16.404 4.404  3.595 -3.920  2.728  -3.033 C02 Q1O 2  
Q1O C03 C2  C 0 1 N N S 15.035 5.200  4.197 -2.490  3.169  -3.427 C03 Q1O 3  
Q1O C05 C3  C 0 1 N N R 15.029 6.366  3.724 -1.585  2.507  -2.370 C05 Q1O 4  
Q1O C06 C4  C 0 1 N N N 15.716 7.439  4.614 -0.785  3.578  -1.626 C06 Q1O 5  
Q1O C14 C5  C 0 1 N N N 21.390 10.071 4.416 5.536   1.333  2.470  C14 Q1O 6  
Q1O C15 C6  C 0 1 N N R 21.728 10.420 5.710 5.950   -0.138 2.390  C15 Q1O 7  
Q1O C17 C7  C 0 1 N N R 23.748 9.761  6.421 7.202   -1.486 0.984  C17 Q1O 8  
Q1O C19 C8  C 0 1 Y N N 24.726 9.666  4.056 7.690   -0.617 -1.334 C19 Q1O 9  
Q1O C21 C9  C 0 1 Y N N 25.887 7.775  4.335 8.890   -2.226 -2.144 C21 Q1O 10 
Q1O C22 C10 C 0 1 Y N N 25.238 8.077  5.497 8.552   -2.579 -0.843 C22 Q1O 11 
Q1O C24 C11 C 0 1 N N N 26.172 6.011  6.676 9.764   -4.599 -1.107 C24 Q1O 12 
Q1O C27 C12 C 0 1 N N N 26.764 6.493  4.313 9.715   -3.157 -2.921 C27 Q1O 13 
Q1O C29 C13 C 0 1 N N R 23.600 11.431 6.428 8.224   -0.924 2.004  C29 Q1O 14 
Q1O C31 C14 C 0 1 N N S 22.692 11.654 5.568 7.300   -0.343 3.102  C31 Q1O 15 
Q1O C36 C15 C 0 1 N N R 16.824 5.092  2.511 -3.646  1.469  -2.172 C36 Q1O 16 
Q1O C38 C16 C 0 1 Y N N 18.546 6.843  2.526 -5.657  0.316  -1.544 C38 Q1O 17 
Q1O C39 C17 C 0 1 Y N N 19.863 7.299  2.685 -6.715  0.061  -0.693 C39 Q1O 18 
Q1O C40 C18 C 0 1 Y N N 19.189 4.685  2.981 -4.820  1.928  -0.128 C40 Q1O 19 
Q1O C41 C19 C 0 1 Y N N 20.527 5.062  3.147 -5.850  1.728  0.772  C41 Q1O 20 
Q1O C42 C20 C 0 1 Y N N 20.872 6.399  3.009 -6.819  0.777  0.489  C42 Q1O 21 
Q1O C43 C21 C 0 1 N N S 22.332 6.880  3.171 -7.958  0.530  1.444  C43 Q1O 22 
Q1O C45 C22 C 0 1 N N N 23.103 5.239  4.874 -9.612  -1.170 0.886  C45 Q1O 23 
Q1O C47 C23 C 0 1 N N N 23.780 3.628  6.667 -11.340 -2.784 0.296  C47 Q1O 24 
Q1O C48 C24 C 0 1 N N N 22.798 2.436  6.750 -11.527 -4.303 0.296  C48 Q1O 25 
Q1O C53 C25 C 0 1 N N N 24.014 5.136  2.543 -7.468  -1.941 1.748  C53 Q1O 26 
Q1O C54 C26 C 0 1 N N N 22.766 7.496  1.857 -7.499  0.825  2.873  C54 Q1O 27 
Q1O F49 F1  F 0 1 N N N 21.550 2.830  6.380 -10.563 -4.891 -0.531 F49 Q1O 28 
Q1O F50 F2  F 0 1 N N N 22.762 1.977  8.025 -11.384 -4.791 1.599  F50 Q1O 29 
Q1O F51 F3  F 0 1 N N N 23.235 1.422  5.945 -12.804 -4.615 -0.182 F51 Q1O 30 
Q1O N18 N1  N 0 1 Y N N 24.527 9.236  5.327 7.795   -1.559 -0.353 N18 Q1O 31 
Q1O N20 N2  N 0 1 Y N N 25.583 8.760  3.424 8.339   -1.015 -2.391 N20 Q1O 32 
Q1O N23 N3  N 0 1 N N N 25.342 7.212  6.720 9.002   -3.774 -0.343 N23 Q1O 33 
Q1O N25 N4  N 0 1 N N N 26.266 5.166  7.901 10.193  -5.783 -0.571 N25 Q1O 34 
Q1O N26 N5  N 0 1 N N N 26.876 5.662  5.482 10.106  -4.303 -2.343 N26 Q1O 35 
Q1O N37 N6  N 1 1 Y N N 18.241 5.564  2.674 -4.753  1.228  -1.243 N37 Q1O 36 
Q1O N44 N7  N 0 1 N N N 23.154 5.757  3.513 -8.382  -0.869 1.346  N44 Q1O 37 
Q1O N46 N8  N 0 1 N N N 23.909 4.087  5.273 -10.002 -2.457 0.796  N46 Q1O 38 
Q1O O01 O2  O 0 1 N N N 16.100 3.085  3.238 -4.689  2.397  -4.191 O01 Q1O 39 
Q1O O04 O3  O 0 1 N N N 13.837 4.479  3.722 -2.163  2.697  -4.736 O04 Q1O 40 
Q1O O07 O4  O 0 1 N N N 15.775 8.663  3.870 0.134   2.949  -0.730 O07 Q1O 41 
Q1O O09 O5  O 0 1 N N N 15.640 11.242 3.466 1.951   4.697  -0.610 O09 Q1O 42 
Q1O O12 O6  O 0 1 N N N 18.612 11.137 2.761 4.360   3.894  1.117  O12 Q1O 43 
Q1O O13 O7  O 0 1 N N N 20.017 9.745  4.399 4.238   1.495  1.895  O13 Q1O 44 
Q1O O16 O8  O 0 1 N N N 22.559 9.279  6.373 6.129   -0.521 1.016  O16 Q1O 45 
Q1O O28 O9  O 0 1 N N N 27.349 6.169  3.329 10.039  -2.895 -4.068 O28 Q1O 46 
Q1O O30 O10 O 0 1 N N N 23.151 11.880 7.720 9.047   -1.967 2.530  O30 Q1O 47 
Q1O O32 O11 O 0 1 N N N 21.963 12.939 5.821 7.161   -1.269 4.181  O32 Q1O 48 
Q1O O33 O12 O 0 1 N N N 19.407 12.199 4.873 3.167   3.445  3.296  O33 Q1O 49 
Q1O O34 O13 O 0 1 N N N 15.211 10.450 5.785 0.292   4.623  1.291  O34 Q1O 50 
Q1O O35 O14 O 0 1 N N N 15.858 6.249  2.311 -2.443  1.810  -1.450 O35 Q1O 51 
Q1O O52 O15 O 0 1 N N N 22.394 5.742  5.653 -10.371 -0.280 0.553  O52 Q1O 52 
Q1O P08 P1  P 0 1 N N N 16.013 10.199 4.525 1.140   3.775  0.217  P08 Q1O 53 
Q1O P11 P2  P 0 1 N N N 18.910 10.939 4.227 3.489   2.918  1.809  P11 Q1O 54 
Q1O H1  H1  H 0 1 N N N 17.159 4.421  4.395 -4.418  3.500  -2.446 H1  Q1O 55 
Q1O H2  H2  H 0 1 N N N 15.088 5.165  5.295 -2.399  4.254  -3.381 H2  Q1O 56 
Q1O H3  H3  H 0 1 N N N 14.017 6.720  3.479 -0.905  1.804  -2.852 H3  Q1O 57 
Q1O H4  H4  H 0 1 N N N 15.132 7.590  5.534 -0.234  4.185  -2.344 H4  Q1O 58 
Q1O H5  H5  H 0 1 N N N 16.733 7.112  4.875 -1.466  4.213  -1.060 H5  Q1O 59 
Q1O H6  H6  H 0 1 N N N 21.984 9.202  4.096 5.514   1.648  3.513  H6  Q1O 60 
Q1O H7  H7  H 0 1 N N N 21.582 10.916 3.739 6.255   1.942  1.922  H7  Q1O 61 
Q1O H8  H8  H 0 1 N N N 20.860 10.680 6.334 5.186   -0.763 2.852  H8  Q1O 62 
Q1O H9  H9  H 0 1 N N N 24.245 9.497  7.366 6.846   -2.467 1.299  H9  Q1O 63 
Q1O H10 H10 H 0 1 N N N 24.298 10.552 3.611 7.149   0.313  -1.249 H10 Q1O 64 
Q1O H11 H11 H 0 1 N N N 24.579 11.863 6.174 8.833   -0.140 1.553  H11 Q1O 65 
Q1O H12 H12 H 0 1 N N N 23.082 11.663 4.539 7.688   0.609  3.466  H12 Q1O 66 
Q1O H13 H13 H 0 1 N N N 16.777 4.455  1.615 -3.482  0.598  -2.806 H13 Q1O 67 
Q1O H14 H14 H 0 1 N N N 17.767 7.549  2.278 -5.566  -0.242 -2.465 H14 Q1O 68 
Q1O H15 H15 H 0 1 N N N 20.093 8.346  2.556 -7.452  -0.687 -0.946 H15 Q1O 69 
Q1O H16 H16 H 0 1 N N N 18.919 3.647  3.106 -4.061  2.666  0.085  H16 Q1O 70 
Q1O H17 H17 H 0 1 N N N 21.280 4.323  3.379 -5.899  2.305  1.684  H17 Q1O 71 
Q1O H18 H18 H 0 1 N N N 22.372 7.643  3.963 -8.794  1.181  1.189  H18 Q1O 72 
Q1O H19 H19 H 0 1 N N N 24.766 3.312  7.038 -11.451 -2.404 -0.719 H19 Q1O 73 
Q1O H20 H20 H 0 1 N N N 23.402 4.454  7.288 -12.090 -2.326 0.941  H20 Q1O 74 
Q1O H21 H21 H 0 1 N N N 24.552 4.299  3.012 -7.675  -2.227 2.780  H21 Q1O 75 
Q1O H22 H22 H 0 1 N N N 23.409 4.760  1.705 -7.610  -2.803 1.097  H22 Q1O 76 
Q1O H23 H23 H 0 1 N N N 24.739 5.874  2.170 -6.439  -1.590 1.668  H23 Q1O 77 
Q1O H24 H24 H 0 1 N N N 23.804 7.849  1.942 -6.663  0.173  3.128  H24 Q1O 78 
Q1O H25 H25 H 0 1 N N N 22.699 6.742  1.059 -7.184  1.866  2.946  H25 Q1O 79 
Q1O H26 H26 H 0 1 N N N 22.109 8.345  1.615 -8.323  0.646  3.564  H26 Q1O 80 
Q1O H27 H27 H 0 1 N N N 24.849 7.455  7.555 8.773   -4.032 0.563  H27 Q1O 81 
Q1O H28 H28 H 0 1 N N N 26.829 4.339  7.896 9.951   -6.020 0.338  H28 Q1O 82 
Q1O H29 H29 H 0 1 N N N 25.766 5.426  8.727 10.739  -6.386 -1.100 H29 Q1O 83 
Q1O H30 H30 H 0 1 N N N 24.521 3.630  4.628 -9.397  -3.167 1.063  H30 Q1O 84 
Q1O H31 H31 H 0 1 N N N 15.806 2.609  4.005 -4.811  3.133  -4.806 H31 Q1O 85 
Q1O H32 H32 H 0 1 N N N 13.057 4.911  4.049 -2.740  3.038  -5.433 H32 Q1O 86 
Q1O H33 H33 H 0 1 N N N 23.828 11.715 8.366 9.703   -1.664 3.173  H33 Q1O 87 
Q1O H34 H34 H 0 1 N N N 22.565 13.668 5.730 7.982   -1.435 4.665  H34 Q1O 88 
Q1O H35 H35 H 0 1 N N N 19.441 12.895 4.227 2.599   2.854  3.809  H35 Q1O 89 
Q1O H36 H36 H 0 1 N N N 14.644 11.201 5.656 -0.264  4.082  1.868  H36 Q1O 90 
# 
loop_
_chem_comp_bond.comp_id 
_chem_comp_bond.atom_id_1 
_chem_comp_bond.atom_id_2 
_chem_comp_bond.value_order 
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag 
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config 
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal 
Q1O C54 C43 SING N N 1  
Q1O O35 C36 SING N N 2  
Q1O O35 C05 SING N N 3  
Q1O C36 N37 SING N N 4  
Q1O C36 C02 SING N N 5  
Q1O C38 N37 DOUB Y N 6  
Q1O C38 C39 SING Y N 7  
Q1O C53 N44 SING N N 8  
Q1O N37 C40 SING Y N 9  
Q1O C39 C42 DOUB Y N 10 
Q1O O12 P11 DOUB N N 11 
Q1O C40 C41 DOUB Y N 12 
Q1O C42 C41 SING Y N 13 
Q1O C42 C43 SING N N 14 
Q1O C43 N44 SING N N 15 
Q1O O01 C02 SING N N 16 
Q1O O28 C27 DOUB N N 17 
Q1O N20 C19 DOUB Y N 18 
Q1O N20 C21 SING Y N 19 
Q1O O09 P08 DOUB N N 20 
Q1O N44 C45 SING N N 21 
Q1O C02 C03 SING N N 22 
Q1O O04 C03 SING N N 23 
Q1O C05 C03 SING N N 24 
Q1O C05 C06 SING N N 25 
Q1O O07 P08 SING N N 26 
Q1O O07 C06 SING N N 27 
Q1O C19 N18 SING Y N 28 
Q1O P11 O13 SING N N 29 
Q1O P11 O33 SING N N 30 
Q1O P11 O10 SING N N 31 
Q1O C27 C21 SING N N 32 
Q1O C27 N26 SING N N 33 
Q1O C21 C22 DOUB Y N 34 
Q1O O13 C14 SING N N 35 
Q1O C14 C15 SING N N 36 
Q1O P08 O10 SING N N 37 
Q1O P08 O34 SING N N 38 
Q1O C45 N46 SING N N 39 
Q1O C45 O52 DOUB N N 40 
Q1O N46 C47 SING N N 41 
Q1O N18 C22 SING Y N 42 
Q1O N18 C17 SING N N 43 
Q1O N26 C24 DOUB N N 44 
Q1O C22 N23 SING N N 45 
Q1O C31 C15 SING N N 46 
Q1O C31 O32 SING N N 47 
Q1O C31 C29 SING N N 48 
Q1O C15 O16 SING N N 49 
Q1O F51 C48 SING N N 50 
Q1O O16 C17 SING N N 51 
Q1O F49 C48 SING N N 52 
Q1O C17 C29 SING N N 53 
Q1O C29 O30 SING N N 54 
Q1O C47 C48 SING N N 55 
Q1O C24 N23 SING N N 56 
Q1O C24 N25 SING N N 57 
Q1O C48 F50 SING N N 58 
Q1O C02 H1  SING N N 59 
Q1O C03 H2  SING N N 60 
Q1O C05 H3  SING N N 61 
Q1O C06 H4  SING N N 62 
Q1O C06 H5  SING N N 63 
Q1O C14 H6  SING N N 64 
Q1O C14 H7  SING N N 65 
Q1O C15 H8  SING N N 66 
Q1O C17 H9  SING N N 67 
Q1O C19 H10 SING N N 68 
Q1O C29 H11 SING N N 69 
Q1O C31 H12 SING N N 70 
Q1O C36 H13 SING N N 71 
Q1O C38 H14 SING N N 72 
Q1O C39 H15 SING N N 73 
Q1O C40 H16 SING N N 74 
Q1O C41 H17 SING N N 75 
Q1O C43 H18 SING N N 76 
Q1O C47 H19 SING N N 77 
Q1O C47 H20 SING N N 78 
Q1O C53 H21 SING N N 79 
Q1O C53 H22 SING N N 80 
Q1O C53 H23 SING N N 81 
Q1O C54 H24 SING N N 82 
Q1O C54 H25 SING N N 83 
Q1O C54 H26 SING N N 84 
Q1O N23 H27 SING N N 85 
Q1O N25 H28 SING N N 86 
Q1O N25 H29 SING N N 87 
Q1O N46 H30 SING N N 88 
Q1O O01 H31 SING N N 89 
Q1O O04 H32 SING N N 90 
Q1O O30 H33 SING N N 91 
Q1O O32 H34 SING N N 92 
Q1O O33 H35 SING N N 93 
Q1O O34 H36 SING N N 94 
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id 
_pdbx_chem_comp_descriptor.type 
_pdbx_chem_comp_descriptor.program 
_pdbx_chem_comp_descriptor.program_version 
_pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor 
Q1O SMILES           ACDLabs              12.01 "FC(F)(F)CNC(=O)N(C)C(C)c1cc[n+](cc1)C1OC(COP(=O)(O)OP(=O)(O)OCC2OC(n3cnc4c3NC(N)=NC4=O)C(O)C2O)C(O)C1O"                                                                                                                                                                                                                               
Q1O InChI            InChI                1.03  "InChI=1S/C26H35F3N8O15P2/c1-11(35(2)25(43)31-9-26(27,28)29)12-3-5-36(6-4-12)22-18(40)16(38)13(50-22)7-48-53(44,45)52-54(46,47)49-8-14-17(39)19(41)23(51-14)37-10-32-15-20(37)33-24(30)34-21(15)42/h3-6,10-11,13-14,16-19,22-23,38-41H,7-9H2,1-2H3,(H5-,30,31,33,34,42,43,44,45,46,47)/p+1/t11-,13+,14+,16+,17+,18+,19+,22+,23+/m0/s1" 
Q1O InChIKey         InChI                1.03  AXVQRIRSWQIBFH-NAZZXAPQSA-O                                                                                                                                                                                                                                                                                                            
Q1O SMILES_CANONICAL CACTVS               3.385 "C[C@H](N(C)C(=O)NCC(F)(F)F)c1cc[n+](cc1)[C@@H]2O[C@H](CO[P](O)(=O)O[P](O)(=O)OC[C@H]3O[C@H]([C@H](O)[C@@H]3O)n4cnc5C(=O)N=C(N)Nc45)[C@@H](O)[C@H]2O"                                                                                                                                                                                  
Q1O SMILES           CACTVS               3.385 "C[CH](N(C)C(=O)NCC(F)(F)F)c1cc[n+](cc1)[CH]2O[CH](CO[P](O)(=O)O[P](O)(=O)OC[CH]3O[CH]([CH](O)[CH]3O)n4cnc5C(=O)N=C(N)Nc45)[CH](O)[CH]2O"                                                                                                                                                                                              
Q1O SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 2.0.7 "C[C@@H](c1cc[n+](cc1)[C@H]2[C@@H]([C@@H]([C@H](O2)COP(=O)(O)OP(=O)(O)OC[C@@H]3[C@H]([C@H]([C@@H](O3)n4cnc5c4NC(=NC5=O)N)O)O)O)O)N(C)C(=O)NCC(F)(F)F"                                                                                                                                                                                  
Q1O SMILES           "OpenEye OEToolkits" 2.0.7 "CC(c1cc[n+](cc1)C2C(C(C(O2)COP(=O)(O)OP(=O)(O)OCC3C(C(C(O3)n4cnc5c4NC(=NC5=O)N)O)O)O)O)N(C)C(=O)NCC(F)(F)F"                                                                                                                                                                                                                           
# 
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_pdbx_chem_comp_identifier.comp_id 
_pdbx_chem_comp_identifier.type 
_pdbx_chem_comp_identifier.program 
_pdbx_chem_comp_identifier.program_version 
_pdbx_chem_comp_identifier.identifier 
Q1O "SYSTEMATIC NAME" ACDLabs              12.01 "1-[(2R,3R,4S,5R)-5-({[(R)-{[(S)-{[(2R,3S,4R,5R)-5-(2-amino-6-oxo-3,6-dihydro-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methoxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}methyl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]-4-{(1S)-1-[N-methyl(2,2,2-trifluoroethyl)carbamamido]ethyl}pyridin-1-ium (non-preferred name)"       
Q1O "SYSTEMATIC NAME" "OpenEye OEToolkits" 2.0.7 "[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-[4-[(1~{S})-1-[methyl-[2,2,2-tris(fluoranyl)ethylcarbamoyl]amino]ethyl]pyridin-1-ium-1-yl]-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl hydrogen phosphate" 
# 
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_pdbx_chem_comp_audit.comp_id 
_pdbx_chem_comp_audit.action_type 
_pdbx_chem_comp_audit.date 
_pdbx_chem_comp_audit.processing_site 
Q1O "Create component" 2022-05-31 RCSB 
Q1O "Initial release"  2022-09-21 RCSB 
# 
