data_6GN
# 
_chem_comp.id                                    6GN 
_chem_comp.name                                  "1-(17-amino-5,8-dioxo-12,15-dioxa-4,9-diazaheptadecan-1-yl)-4-{[3-(3-sulfopropyl)-1,3-benzothiazol-3-ium-2-yl]methyl}quinolin-1-ium" 
_chem_comp.type                                  NON-POLYMER 
_chem_comp.pdbx_type                             HETAIN 
_chem_comp.formula                               "C33 H45 N5 O7 S2" 
_chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id               ? 
_chem_comp.pdbx_synonyms                         ? 
_chem_comp.pdbx_formal_charge                    2 
_chem_comp.pdbx_initial_date                     2016-04-06 
_chem_comp.pdbx_modified_date                    2016-05-20 
_chem_comp.pdbx_ambiguous_flag                   N 
_chem_comp.pdbx_release_status                   REL 
_chem_comp.pdbx_replaced_by                      ? 
_chem_comp.pdbx_replaces                         ? 
_chem_comp.formula_weight                        687.870 
_chem_comp.one_letter_code                       ? 
_chem_comp.three_letter_code                     6GN 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_details        ? 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag   N 
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details        Corina 
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag   N 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code        5J74 
_chem_comp.pdbx_subcomponent_list                ? 
_chem_comp.pdbx_processing_site                  RCSB 
# 
loop_
_chem_comp_atom.comp_id 
_chem_comp_atom.atom_id 
_chem_comp_atom.alt_atom_id 
_chem_comp_atom.type_symbol 
_chem_comp_atom.charge 
_chem_comp_atom.pdbx_align 
_chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag 
_chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag 
_chem_comp_atom.pdbx_stereo_config 
_chem_comp_atom.model_Cartn_x 
_chem_comp_atom.model_Cartn_y 
_chem_comp_atom.model_Cartn_z 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id 
_chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id 
_chem_comp_atom.pdbx_ordinal 
6GN C   C1  C 0 1 N N N 17.190 -27.321 -35.369 13.804  3.427  -0.711 C   6GN 1  
6GN N   N1  N 0 1 N N N 17.532 -26.385 -36.441 15.044  3.155  0.029  N   6GN 2  
6GN O   O1  O 0 1 N N N 15.906 -29.421 -35.206 13.261  1.081  -0.925 O   6GN 3  
6GN C2  C2  C 0 1 N N N 16.354 -29.766 -33.891 12.982  -0.064 -1.733 C2  6GN 4  
6GN N2  N2  N 0 1 N N N 16.389 -34.943 -25.519 2.747   -0.562 0.357  N2  6GN 5  
6GN O2  O2  O 0 1 N N N 17.028 -34.605 -30.343 7.379   -1.205 2.266  O2  6GN 6  
6GN C3  C3  C 0 1 N N N 17.584 -30.642 -33.988 12.722  -1.273 -0.832 C3  6GN 7  
6GN N3  N3  N 1 1 Y N N 13.352 -35.644 -22.780 -2.047  0.303  -0.074 N3  6GN 8  
6GN O3  O3  O 0 1 N N N 16.560 -37.002 -26.420 4.169   -1.046 -1.275 O3  6GN 9  
6GN C4  C4  C 0 1 N N N 18.314 -31.763 -31.974 11.201  -2.127 0.812  C4  6GN 10 
6GN N4  N4  N 1 1 Y N N 8.574  -38.215 -18.879 -7.616  0.703  0.643  N4  6GN 11 
6GN O4  O4  O 0 1 N N N 7.872  -43.002 -22.741 -6.057  -5.461 0.056  O4  6GN 12 
6GN C5  C5  C 0 1 N N N 16.986 -31.852 -31.275 9.920   -1.782 1.574  C5  6GN 13 
6GN C6  C6  C 0 1 N N N 16.837 -33.650 -29.586 7.565   -1.393 1.082  C6  6GN 14 
6GN C7  C7  C 0 1 N N N 16.320 -33.834 -28.165 6.415   -1.298 0.114  C7  6GN 15 
6GN C8  C8  C 0 1 N N N 15.794 -35.244 -27.868 5.134   -0.953 0.877  C8  6GN 16 
6GN C9  C9  C 0 1 N N N 16.293 -35.803 -26.541 3.983   -0.857 -0.092 C9  6GN 17 
6GN C10 C10 C 0 1 N N N 16.883 -35.313 -24.197 1.628   -0.468 -0.584 C10 6GN 18 
6GN C11 C11 C 0 1 N N N 15.765 -35.751 -23.261 0.347   -0.124 0.179  C11 6GN 19 
6GN C12 C12 C 0 1 N N N 14.504 -34.907 -23.344 -0.821  -0.026 -0.804 C12 6GN 20 
6GN O6  O5  O 0 1 N N N 9.766  -41.500 -22.957 -4.624  -3.749 -0.590 O6  6GN 21 
6GN S   S1  S 0 1 N N N 8.419  -41.688 -22.437 -6.008  -4.071 -0.562 S   6GN 22 
6GN O5  O6  O 0 1 N N N 7.519  -40.608 -22.816 -6.756  -4.195 -1.763 O5  6GN 23 
6GN C20 C13 C 0 1 N N N 8.562  -41.604 -20.669 -6.882  -3.015 0.626  C20 6GN 24 
6GN C19 C14 C 0 1 N N N 8.961  -40.294 -20.234 -6.900  -1.575 0.112  C19 6GN 25 
6GN C18 C15 C 0 1 N N N 8.029  -39.507 -19.351 -7.637  -0.684 1.114  C18 6GN 26 
6GN C21 C16 C 0 1 Y N N 8.164  -37.704 -17.638 -8.528  1.151  -0.241 C21 6GN 27 
6GN C26 C17 C 0 1 Y N N 8.784  -36.488 -17.345 -8.328  2.499  -0.556 C26 6GN 28 
6GN C25 C18 C 0 1 Y N N 8.511  -35.830 -16.152 -9.175  3.143  -1.456 C25 6GN 29 
6GN C24 C19 C 0 1 Y N N 7.615  -36.395 -15.260 -10.213 2.452  -2.039 C24 6GN 30 
6GN C23 C20 C 0 1 Y N N 7.000  -37.602 -15.548 -10.417 1.114  -1.730 C23 6GN 31 
6GN C22 C21 C 0 1 Y N N 7.257  -38.256 -16.741 -9.599  0.468  -0.853 C22 6GN 32 
6GN S1  S2  S 0 1 Y N N 9.847  -35.991 -18.637 -6.933  3.069  0.354  S1  6GN 33 
6GN C17 C22 C 0 1 Y N N 9.469  -37.419 -19.539 -6.734  1.529  1.062  C17 6GN 34 
6GN C16 C23 C 0 1 N N N 10.085 -37.658 -20.878 -5.649  1.183  2.049  C16 6GN 35 
6GN C15 C24 C 0 1 Y N N 11.228 -36.936 -21.554 -4.373  0.880  1.307  C15 6GN 36 
6GN C14 C25 C 0 1 Y N N 12.045 -36.077 -20.864 -4.028  -0.406 1.001  C14 6GN 37 
6GN C13 C26 C 0 1 Y N N 13.086 -35.444 -21.488 -2.849  -0.662 0.304  C13 6GN 38 
6GN C27 C27 C 0 1 Y N N 11.503 -37.191 -22.925 -3.504  1.913  0.909  C27 6GN 39 
6GN C32 C28 C 0 1 Y N N 12.591 -36.522 -23.540 -2.324  1.583  0.198  C32 6GN 40 
6GN C31 C29 C 0 1 Y N N 12.859 -36.756 -24.900 -1.460  2.614  -0.209 C31 6GN 41 
6GN C30 C30 C 0 1 Y N N 12.076 -37.620 -25.618 -1.768  3.907  0.083  C30 6GN 42 
6GN C29 C31 C 0 1 Y N N 11.014 -38.274 -25.024 -2.928  4.230  0.783  C29 6GN 43 
6GN C28 C32 C 0 1 Y N N 10.723 -38.070 -23.718 -3.789  3.258  1.194  C28 6GN 44 
6GN N1  N5  N 0 1 N N N 17.136 -32.392 -29.932 8.801   -1.689 0.633  N1  6GN 45 
6GN O1  O7  O 0 1 N N N 18.353 -30.591 -32.783 11.535  -1.051 -0.068 O1  6GN 46 
6GN C1  C33 C 0 1 N N N 15.801 -28.028 -35.526 13.519  2.271  -1.673 C1  6GN 47 
6GN H1  H1  H 0 1 N N N 17.967 -28.099 -35.334 12.976  3.526  -0.008 H1  6GN 48 
6GN H2  H2  H 0 1 N N N 17.185 -26.765 -34.420 13.913  4.352  -1.276 H2  6GN 49 
6GN H3  H3  H 0 1 N N N 18.430 -25.983 -36.260 15.814  2.995  -0.604 H3  6GN 50 
6GN H4  H4  H 0 1 N N N 17.555 -26.872 -37.314 15.253  3.904  0.671  H4  6GN 51 
6GN H6  H6  H 0 1 N N N 16.600 -28.849 -33.336 12.101  0.129  -2.345 H6  6GN 52 
6GN H7  H7  H 0 1 N N N 15.557 -30.311 -33.364 13.836  -0.269 -2.379 H7  6GN 53 
6GN H8  H8  H 0 1 N N N 16.107 -33.996 -25.670 2.598   -0.411 1.304  H8  6GN 54 
6GN H9  H9  H 0 1 N N N 17.271 -31.681 -34.170 12.598  -2.164 -1.447 H9  6GN 55 
6GN H10 H10 H 0 1 N N N 18.207 -30.295 -34.826 13.568  -1.412 -0.158 H10 6GN 56 
6GN H11 H11 H 0 1 N N N 18.453 -32.650 -32.609 12.014  -2.283 1.520  H11 6GN 57 
6GN H12 H12 H 0 1 N N N 19.119 -31.718 -31.226 11.044  -3.036 0.231  H12 6GN 58 
6GN H13 H13 H 0 1 N N N 16.546 -30.846 -31.211 9.713   -2.561 2.308  H13 6GN 59 
6GN H14 H14 H 0 1 N N N 16.319 -32.508 -31.853 10.046  -0.827 2.084  H14 6GN 60 
6GN H15 H15 H 0 1 N N N 17.143 -33.618 -27.467 6.621   -0.518 -0.620 H15 6GN 61 
6GN H16 H16 H 0 1 N N N 15.501 -33.118 -28.000 6.288   -2.253 -0.396 H16 6GN 62 
6GN H17 H17 H 0 1 N N N 14.695 -35.209 -27.842 4.927   -1.732 1.610  H17 6GN 63 
6GN H18 H18 H 0 1 N N N 16.120 -35.916 -28.675 5.260   0.002  1.386  H18 6GN 64 
6GN H19 H19 H 0 1 N N N 17.597 -36.142 -24.306 1.835   0.311  -1.318 H19 6GN 65 
6GN H20 H20 H 0 1 N N N 17.394 -34.445 -23.755 1.502   -1.423 -1.094 H20 6GN 66 
6GN H21 H21 H 0 1 N N N 15.499 -36.790 -23.506 0.141   -0.903 0.913  H21 6GN 67 
6GN H22 H22 H 0 1 N N N 16.143 -35.703 -22.229 0.474   0.831  0.689  H22 6GN 68 
6GN H23 H23 H 0 1 N N N 14.652 -33.977 -22.776 -0.947  -0.982 -1.314 H23 6GN 69 
6GN H24 H24 H 0 1 N N N 14.299 -34.665 -24.397 -0.614  0.753  -1.538 H24 6GN 70 
6GN H25 H25 H 0 1 N N N 7.588  -41.848 -20.220 -7.905  -3.372 0.745  H25 6GN 71 
6GN H26 H26 H 0 1 N N N 9.313  -42.335 -20.336 -6.371  -3.051 1.589  H26 6GN 72 
6GN H27 H27 H 0 1 N N N 9.906  -40.410 -19.684 -5.877  -1.218 -0.007 H27 6GN 73 
6GN H28 H28 H 0 1 N N N 9.135  -39.692 -21.138 -7.411  -1.539 -0.850 H28 6GN 74 
6GN H29 H29 H 0 1 N N N 7.108  -39.305 -19.918 -7.146  -0.746 2.085  H29 6GN 75 
6GN H30 H30 H 0 1 N N N 7.790  -40.121 -18.470 -8.670  -1.021 1.207  H30 6GN 76 
6GN H31 H31 H 0 1 N N N 8.991  -34.890 -15.923 -9.017  4.184  -1.696 H31 6GN 77 
6GN H32 H32 H 0 1 N N N 7.394  -35.890 -14.331 -10.869 2.951  -2.737 H32 6GN 78 
6GN H33 H33 H 0 1 N N N 6.314  -38.037 -14.836 -11.234 0.579  -2.191 H33 6GN 79 
6GN H34 H34 H 0 1 N N N 6.758  -39.185 -16.972 -9.773  -0.573 -0.626 H34 6GN 80 
6GN H35 H35 H 0 1 N N N 9.247  -37.558 -21.583 -5.487  2.026  2.721  H35 6GN 81 
6GN H36 H36 H 0 1 N N N 10.411 -38.708 -20.842 -5.950  0.310  2.628  H36 6GN 82 
6GN H37 H37 H 0 1 N N N 11.865 -35.898 -19.814 -4.673  -1.222 1.292  H37 6GN 83 
6GN H38 H38 H 0 1 N N N 13.707 -34.766 -20.921 -2.589  -1.684 0.069  H38 6GN 84 
6GN H39 H39 H 0 1 N N N 13.685 -36.253 -25.380 -0.555  2.381  -0.751 H39 6GN 85 
6GN H40 H40 H 0 1 N N N 12.291 -37.792 -26.662 -1.100  4.696  -0.232 H40 6GN 86 
6GN H41 H41 H 0 1 N N N 10.411 -38.954 -25.607 -3.148  5.264  1.002  H41 6GN 87 
6GN H42 H42 H 0 1 N N N 9.884  -38.585 -23.273 -4.686  3.521  1.735  H42 6GN 88 
6GN H43 H43 H 0 1 N N N 17.486 -31.783 -29.220 8.950   -1.840 -0.314 H43 6GN 89 
6GN H44 H44 H 0 1 N N N 15.076 -27.555 -34.848 12.650  2.513  -2.283 H44 6GN 90 
6GN H45 H45 H 0 1 N N N 15.456 -27.921 -36.565 14.384  2.115  -2.317 H45 6GN 91 
6GN H5  H5  H 0 1 N N N 7.014  -42.904 -23.137 -5.623  -6.143 -0.474 H5  6GN 92 
# 
loop_
_chem_comp_bond.comp_id 
_chem_comp_bond.atom_id_1 
_chem_comp_bond.atom_id_2 
_chem_comp_bond.value_order 
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag 
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config 
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal 
6GN N   C   SING N N 1  
6GN C1  C   SING N N 2  
6GN C1  O   SING N N 3  
6GN O   C2  SING N N 4  
6GN C3  C2  SING N N 5  
6GN C3  O1  SING N N 6  
6GN O1  C4  SING N N 7  
6GN C4  C5  SING N N 8  
6GN C5  N1  SING N N 9  
6GN O2  C6  DOUB N N 10 
6GN N1  C6  SING N N 11 
6GN C6  C7  SING N N 12 
6GN C7  C8  SING N N 13 
6GN C8  C9  SING N N 14 
6GN C9  O3  DOUB N N 15 
6GN C9  N2  SING N N 16 
6GN C30 C29 DOUB Y N 17 
6GN C30 C31 SING Y N 18 
6GN N2  C10 SING N N 19 
6GN C29 C28 SING Y N 20 
6GN C31 C32 DOUB Y N 21 
6GN C10 C11 SING N N 22 
6GN C28 C27 DOUB Y N 23 
6GN C32 C27 SING Y N 24 
6GN C32 N3  SING Y N 25 
6GN C12 C11 SING N N 26 
6GN C12 N3  SING N N 27 
6GN O6  S   DOUB N N 28 
6GN C27 C15 SING Y N 29 
6GN O5  S   DOUB N N 30 
6GN N3  C13 DOUB Y N 31 
6GN O4  S   SING N N 32 
6GN S   C20 SING N N 33 
6GN C15 C16 SING N N 34 
6GN C15 C14 DOUB Y N 35 
6GN C13 C14 SING Y N 36 
6GN C16 C17 SING N N 37 
6GN C20 C19 SING N N 38 
6GN C19 C18 SING N N 39 
6GN C17 N4  DOUB Y N 40 
6GN C17 S1  SING Y N 41 
6GN C18 N4  SING N N 42 
6GN N4  C21 SING Y N 43 
6GN S1  C26 SING Y N 44 
6GN C21 C26 DOUB Y N 45 
6GN C21 C22 SING Y N 46 
6GN C26 C25 SING Y N 47 
6GN C22 C23 DOUB Y N 48 
6GN C25 C24 DOUB Y N 49 
6GN C23 C24 SING Y N 50 
6GN C   H1  SING N N 51 
6GN C   H2  SING N N 52 
6GN N   H3  SING N N 53 
6GN N   H4  SING N N 54 
6GN C2  H6  SING N N 55 
6GN C2  H7  SING N N 56 
6GN N2  H8  SING N N 57 
6GN C3  H9  SING N N 58 
6GN C3  H10 SING N N 59 
6GN C4  H11 SING N N 60 
6GN C4  H12 SING N N 61 
6GN C5  H13 SING N N 62 
6GN C5  H14 SING N N 63 
6GN C7  H15 SING N N 64 
6GN C7  H16 SING N N 65 
6GN C8  H17 SING N N 66 
6GN C8  H18 SING N N 67 
6GN C10 H19 SING N N 68 
6GN C10 H20 SING N N 69 
6GN C11 H21 SING N N 70 
6GN C11 H22 SING N N 71 
6GN C12 H23 SING N N 72 
6GN C12 H24 SING N N 73 
6GN C20 H25 SING N N 74 
6GN C20 H26 SING N N 75 
6GN C19 H27 SING N N 76 
6GN C19 H28 SING N N 77 
6GN C18 H29 SING N N 78 
6GN C18 H30 SING N N 79 
6GN C25 H31 SING N N 80 
6GN C24 H32 SING N N 81 
6GN C23 H33 SING N N 82 
6GN C22 H34 SING N N 83 
6GN C16 H35 SING N N 84 
6GN C16 H36 SING N N 85 
6GN C14 H37 SING N N 86 
6GN C13 H38 SING N N 87 
6GN C31 H39 SING N N 88 
6GN C30 H40 SING N N 89 
6GN C29 H41 SING N N 90 
6GN C28 H42 SING N N 91 
6GN N1  H43 SING N N 92 
6GN C1  H44 SING N N 93 
6GN C1  H45 SING N N 94 
6GN O4  H5  SING N N 95 
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id 
_pdbx_chem_comp_descriptor.type 
_pdbx_chem_comp_descriptor.program 
_pdbx_chem_comp_descriptor.program_version 
_pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor 
6GN SMILES           ACDLabs              12.01 "C(N)COCCOCCNC(=O)CCC(NCCC[n+]3ccc(Cc2[n+](c1c(cccc1)s2)CCCS(O)(=O)=O)c4c3cccc4)=O" 
6GN InChI            InChI                1.03  
"InChI=1S/C33H43N5O7S2/c34-14-20-44-22-23-45-21-16-36-32(40)12-11-31(39)35-15-5-17-37-19-13-26(27-7-1-2-8-28(27)37)25-33-38(18-6-24-47(41,42)43)29-9-3-4-10-30(29)46-33/h1-4,7-10,13,19H,5-6,11-12,14-18,20-25,34H2,(H-2,35,36,39,40,41,42,43)/p+2" 
6GN InChIKey         InChI                1.03  WTDQEZATLRLHFH-UHFFFAOYSA-P 
6GN SMILES_CANONICAL CACTVS               3.385 "NCCOCCOCCNC(=O)CCC(=O)NCCC[n+]1ccc(Cc2sc3ccccc3[n+]2CCC[S](O)(=O)=O)c4ccccc14" 
6GN SMILES           CACTVS               3.385 "NCCOCCOCCNC(=O)CCC(=O)NCCC[n+]1ccc(Cc2sc3ccccc3[n+]2CCC[S](O)(=O)=O)c4ccccc14" 
6GN SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 2.0.4 "c1ccc2c(c1)c(cc[n+]2CCCNC(=O)CCC(=O)NCCOCCOCCN)Cc3[n+](c4ccccc4s3)CCCS(=O)(=O)O" 
6GN SMILES           "OpenEye OEToolkits" 2.0.4 "c1ccc2c(c1)c(cc[n+]2CCCNC(=O)CCC(=O)NCCOCCOCCN)Cc3[n+](c4ccccc4s3)CCCS(=O)(=O)O" 
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_identifier.comp_id 
_pdbx_chem_comp_identifier.type 
_pdbx_chem_comp_identifier.program 
_pdbx_chem_comp_identifier.program_version 
_pdbx_chem_comp_identifier.identifier 
6GN "SYSTEMATIC NAME" ACDLabs              12.01 "1-(17-amino-5,8-dioxo-12,15-dioxa-4,9-diazaheptadecan-1-yl)-4-{[3-(3-sulfopropyl)-1,3-benzothiazol-3-ium-2-yl]methyl}quinolin-1-ium"                                            
6GN "SYSTEMATIC NAME" "OpenEye OEToolkits" 2.0.4 "3-[2-[[1-[3-[[4-[2-[2-(2-azanylethoxy)ethoxy]ethylamino]-4-oxidanylidene-butanoyl]amino]propyl]quinolin-1-ium-4-yl]methyl]-1,3-benzothiazol-3-ium-3-yl]propane-1-sulfonic acid" 
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_audit.comp_id 
_pdbx_chem_comp_audit.action_type 
_pdbx_chem_comp_audit.date 
_pdbx_chem_comp_audit.processing_site 
6GN "Create component" 2016-04-06 RCSB 
6GN "Initial release"  2016-05-25 RCSB 
# 
