data_6GM
# 
_chem_comp.id                                    6GM 
_chem_comp.name                                  "4-(2-amino-6-{bis[(pyridin-2-yl)methyl]amino}pyrimidin-4-yl)phenol" 
_chem_comp.type                                  NON-POLYMER 
_chem_comp.pdbx_type                             HETAIN 
_chem_comp.formula                               "C22 H20 N6 O" 
_chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id               ? 
_chem_comp.pdbx_synonyms                         ? 
_chem_comp.pdbx_formal_charge                    0 
_chem_comp.pdbx_initial_date                     2016-04-06 
_chem_comp.pdbx_modified_date                    2017-03-03 
_chem_comp.pdbx_ambiguous_flag                   N 
_chem_comp.pdbx_release_status                   REL 
_chem_comp.pdbx_replaced_by                      ? 
_chem_comp.pdbx_replaces                         ? 
_chem_comp.formula_weight                        384.434 
_chem_comp.one_letter_code                       ? 
_chem_comp.three_letter_code                     6GM 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_details        ? 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag   N 
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details        Corina 
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag   N 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code        5J5I 
_chem_comp.pdbx_subcomponent_list                ? 
_chem_comp.pdbx_processing_site                  RCSB 
# 
loop_
_chem_comp_atom.comp_id 
_chem_comp_atom.atom_id 
_chem_comp_atom.alt_atom_id 
_chem_comp_atom.type_symbol 
_chem_comp_atom.charge 
_chem_comp_atom.pdbx_align 
_chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag 
_chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag 
_chem_comp_atom.pdbx_stereo_config 
_chem_comp_atom.model_Cartn_x 
_chem_comp_atom.model_Cartn_y 
_chem_comp_atom.model_Cartn_z 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id 
_chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id 
_chem_comp_atom.pdbx_ordinal 
6GM C10 C1  C 0 1 Y N N 182.742 -30.664 161.923 -3.606 0.991  -0.477 C10 6GM 1  
6GM C13 C2  C 0 1 Y N N 183.294 -25.967 157.326 3.366  -1.948 0.479  C13 6GM 2  
6GM C15 C3  C 0 1 Y N N 183.148 -23.828 158.419 5.020  -0.694 1.648  C15 6GM 3  
6GM C17 C4  C 0 1 N N N 187.770 -27.493 158.044 1.164  1.029  -1.896 C17 6GM 4  
6GM C20 C5  C 0 1 Y N N 190.015 -24.628 160.107 2.376  3.504  1.309  C20 6GM 5  
6GM C21 C6  C 0 1 Y N N 190.641 -25.726 159.520 3.315  3.162  0.348  C21 6GM 6  
6GM C22 C7  C 0 1 Y N N 189.882 -26.678 158.845 2.917  2.351  -0.704 C22 6GM 7  
6GM C06 C8  C 0 1 Y N N 181.948 -28.624 160.895 -4.487 -0.978 0.605  C06 6GM 8  
6GM C07 C9  C 0 1 Y N N 180.631 -28.998 161.171 -5.707 -0.351 0.747  C07 6GM 9  
6GM C08 C10 C 0 1 Y N N 180.366 -30.209 161.818 -5.879 0.947  0.284  C08 6GM 10 
6GM O01 O1  O 0 1 N N N 179.075 -30.584 162.088 -7.082 1.562  0.425  O01 6GM 11 
6GM C09 C11 C 0 1 Y N N 181.427 -31.039 162.197 -4.828 1.613  -0.333 C09 6GM 12 
6GM C05 C12 C 0 1 Y N N 183.010 -29.454 161.277 -3.428 -0.310 -0.008 C05 6GM 13 
6GM C04 C13 C 0 1 Y N N 184.325 -29.090 160.990 -2.115 -0.982 -0.162 C04 6GM 14 
6GM C03 C14 C 0 1 Y N N 184.614 -28.484 159.768 -1.050 -0.320 -0.769 C03 6GM 15 
6GM N03 N1  N 0 1 Y N N 185.322 -29.336 161.864 -1.936 -2.226 0.282  N03 6GM 16 
6GM C01 C15 C 0 1 Y N N 186.589 -28.995 161.576 -0.767 -2.832 0.148  C01 6GM 17 
6GM N01 N2  N 0 1 N N N 187.583 -29.220 162.430 -0.620 -4.124 0.622  N01 6GM 18 
6GM N02 N3  N 0 1 Y N N 186.875 -28.411 160.415 0.266  -2.235 -0.428 N02 6GM 19 
6GM C02 C16 C 0 1 Y N N 185.935 -28.139 159.510 0.164  -0.992 -0.891 C02 6GM 20 
6GM N04 N4  N 0 1 N N N 186.329 -27.571 158.372 1.252  -0.375 -1.488 N04 6GM 21 
6GM C18 C17 C 0 1 Y N N 188.497 -26.522 158.748 1.607  1.912  -0.758 C18 6GM 22 
6GM N06 N5  N 0 1 Y N N 187.890 -25.453 159.308 0.741  2.258  0.174  N06 6GM 23 
6GM C19 C18 C 0 1 Y N N 188.629 -24.484 159.996 1.085  3.024  1.191  C19 6GM 24 
6GM C11 C19 C 0 1 N N N 185.387 -27.173 157.295 2.490  -1.126 -1.711 C11 6GM 25 
6GM C12 C20 C 0 1 Y N N 184.640 -26.058 157.674 3.388  -0.983 -0.509 C12 6GM 26 
6GM N05 N6  N 0 1 Y N N 185.214 -25.069 158.367 4.185  0.064  -0.412 N05 6GM 27 
6GM C16 C21 C 0 1 Y N N 184.494 -23.935 158.760 4.987  0.231  0.621  C16 6GM 28 
6GM C14 C22 C 0 1 Y N N 182.545 -24.851 157.696 4.195  -1.806 1.582  C14 6GM 29 
6GM H1  H1  H 0 1 N N N 183.557 -31.312 162.211 -2.789 1.510  -0.957 H1  6GM 30 
6GM H2  H2  H 0 1 N N N 182.829 -26.765 156.767 2.707  -2.800 0.397  H2  6GM 31 
6GM H3  H3  H 0 1 N N N 182.578 -22.959 158.713 5.679  -0.551 2.491  H3  6GM 32 
6GM H4  H4  H 0 1 N N N 188.220 -28.474 158.257 1.809  1.198  -2.759 H4  6GM 33 
6GM H5  H5  H 0 1 N N N 187.862 -27.273 156.970 0.134  1.267  -2.161 H5  6GM 34 
6GM H6  H6  H 0 1 N N N 190.597 -23.893 160.644 2.651  4.135  2.141  H6  6GM 35 
6GM H7  H7  H 0 1 N N N 191.713 -25.838 159.589 4.331  3.520  0.416  H7  6GM 36 
6GM H8  H8  H 0 1 N N N 190.363 -27.535 158.397 3.622  2.064  -1.471 H8  6GM 37 
6GM H9  H9  H 0 1 N N N 182.148 -27.693 160.386 -4.353 -1.988 0.965  H9  6GM 38 
6GM H10 H10 H 0 1 N N N 179.816 -28.351 160.884 -6.527 -0.868 1.222  H10 6GM 39 
6GM H11 H11 H 0 1 N N N 179.075 -31.426 162.527 -7.178 2.054  1.252  H11 6GM 40 
6GM H12 H12 H 0 1 N N N 181.227 -31.972 162.703 -4.968 2.619  -0.700 H12 6GM 41 
6GM H13 H13 H 0 1 N N N 183.836 -28.289 159.045 -1.163 0.690  -1.136 H13 6GM 42 
6GM H14 H14 H 0 1 N N N 188.442 -28.893 162.036 -1.368 -4.573 1.046  H14 6GM 43 
6GM H15 H15 H 0 1 N N N 187.403 -28.736 163.286 0.231  -4.580 0.531  H15 6GM 44 
6GM H16 H16 H 0 1 N N N 188.133 -23.632 160.437 0.348  3.286  1.935  H16 6GM 45 
6GM H17 H17 H 0 1 N N N 184.704 -28.010 157.086 2.253  -2.179 -1.863 H17 6GM 46 
6GM H18 H18 H 0 1 N N N 185.959 -26.931 156.387 2.998  -0.736 -2.592 H18 6GM 47 
6GM H19 H19 H 0 1 N N N 184.978 -23.150 159.322 5.626  1.101  0.665  H19 6GM 48 
6GM H20 H20 H 0 1 N N N 181.502 -24.782 157.423 4.199  -2.545 2.369  H20 6GM 49 
# 
loop_
_chem_comp_bond.comp_id 
_chem_comp_bond.atom_id_1 
_chem_comp_bond.atom_id_2 
_chem_comp_bond.value_order 
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag 
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config 
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal 
6GM C11 C12 SING N N 1  
6GM C11 N04 SING N N 2  
6GM C13 C12 DOUB Y N 3  
6GM C13 C14 SING Y N 4  
6GM C12 N05 SING Y N 5  
6GM C14 C15 DOUB Y N 6  
6GM C17 N04 SING N N 7  
6GM C17 C18 SING N N 8  
6GM N05 C16 DOUB Y N 9  
6GM N04 C02 SING N N 10 
6GM C15 C16 SING Y N 11 
6GM C18 C22 DOUB Y N 12 
6GM C18 N06 SING Y N 13 
6GM C22 C21 SING Y N 14 
6GM N06 C19 DOUB Y N 15 
6GM C02 C03 DOUB Y N 16 
6GM C02 N02 SING Y N 17 
6GM C21 C20 DOUB Y N 18 
6GM C03 C04 SING Y N 19 
6GM C19 C20 SING Y N 20 
6GM N02 C01 DOUB Y N 21 
6GM C06 C07 DOUB Y N 22 
6GM C06 C05 SING Y N 23 
6GM C04 C05 SING N N 24 
6GM C04 N03 DOUB Y N 25 
6GM C07 C08 SING Y N 26 
6GM C05 C10 DOUB Y N 27 
6GM C01 N03 SING Y N 28 
6GM C01 N01 SING N N 29 
6GM C08 O01 SING N N 30 
6GM C08 C09 DOUB Y N 31 
6GM C10 C09 SING Y N 32 
6GM C10 H1  SING N N 33 
6GM C13 H2  SING N N 34 
6GM C15 H3  SING N N 35 
6GM C17 H4  SING N N 36 
6GM C17 H5  SING N N 37 
6GM C20 H6  SING N N 38 
6GM C21 H7  SING N N 39 
6GM C22 H8  SING N N 40 
6GM C06 H9  SING N N 41 
6GM C07 H10 SING N N 42 
6GM O01 H11 SING N N 43 
6GM C09 H12 SING N N 44 
6GM C03 H13 SING N N 45 
6GM N01 H14 SING N N 46 
6GM N01 H15 SING N N 47 
6GM C19 H16 SING N N 48 
6GM C11 H17 SING N N 49 
6GM C11 H18 SING N N 50 
6GM C16 H19 SING N N 51 
6GM C14 H20 SING N N 52 
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id 
_pdbx_chem_comp_descriptor.type 
_pdbx_chem_comp_descriptor.program 
_pdbx_chem_comp_descriptor.program_version 
_pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor 
6GM SMILES           ACDLabs              12.01 "c1cc(ccc1c2nc(N)nc(c2)N(Cc3ccccn3)Cc4ccccn4)O"                                                                                                 
6GM InChI            InChI                1.03  "InChI=1S/C22H20N6O/c23-22-26-20(16-7-9-19(29)10-8-16)13-21(27-22)28(14-17-5-1-3-11-24-17)15-18-6-2-4-12-25-18/h1-13,29H,14-15H2,(H2,23,26,27)" 
6GM InChIKey         InChI                1.03  LXSAXBJSZAHFFN-UHFFFAOYSA-N                                                                                                                     
6GM SMILES_CANONICAL CACTVS               3.385 "Nc1nc(cc(n1)c2ccc(O)cc2)N(Cc3ccccn3)Cc4ccccn4"                                                                                                 
6GM SMILES           CACTVS               3.385 "Nc1nc(cc(n1)c2ccc(O)cc2)N(Cc3ccccn3)Cc4ccccn4"                                                                                                 
6GM SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 2.0.4 "c1ccnc(c1)CN(Cc2ccccn2)c3cc(nc(n3)N)c4ccc(cc4)O"                                                                                               
6GM SMILES           "OpenEye OEToolkits" 2.0.4 "c1ccnc(c1)CN(Cc2ccccn2)c3cc(nc(n3)N)c4ccc(cc4)O"                                                                                               
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_identifier.comp_id 
_pdbx_chem_comp_identifier.type 
_pdbx_chem_comp_identifier.program 
_pdbx_chem_comp_identifier.program_version 
_pdbx_chem_comp_identifier.identifier 
6GM "SYSTEMATIC NAME" ACDLabs              12.01 "4-(2-amino-6-{bis[(pyridin-2-yl)methyl]amino}pyrimidin-4-yl)phenol" 
6GM "SYSTEMATIC NAME" "OpenEye OEToolkits" 2.0.4 "4-[2-azanyl-6-[bis(pyridin-2-ylmethyl)amino]pyrimidin-4-yl]phenol"  
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_audit.comp_id 
_pdbx_chem_comp_audit.action_type 
_pdbx_chem_comp_audit.date 
_pdbx_chem_comp_audit.processing_site 
6GM "Create component" 2016-04-06 RCSB 
6GM "Initial release"  2017-03-08 RCSB 
# 
