data_QOJ
# 
_chem_comp.id                                    QOJ 
_chem_comp.name                                  "4,4'-(decane-1,10-diyl)bis(9-amino-2,3-dihydro-1H-cyclopenta[b]quinolin-4-ium)" 
_chem_comp.type                                  non-polymer 
_chem_comp.pdbx_type                             HETAIN 
_chem_comp.formula                               "C34 H44 N4" 
_chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id               ? 
_chem_comp.pdbx_synonyms                         ? 
_chem_comp.pdbx_formal_charge                    2 
_chem_comp.pdbx_initial_date                     2019-12-03 
_chem_comp.pdbx_modified_date                    2024-05-08 
_chem_comp.pdbx_ambiguous_flag                   N 
_chem_comp.pdbx_release_status                   REL 
_chem_comp.pdbx_replaced_by                      ? 
_chem_comp.pdbx_replaces                         ? 
_chem_comp.formula_weight                        508.740 
_chem_comp.one_letter_code                       ? 
_chem_comp.three_letter_code                     QOJ 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_details        ? 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag   N 
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details        Corina 
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag   N 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code        6V4T 
_chem_comp.pdbx_subcomponent_list                ? 
_chem_comp.pdbx_processing_site                  RCSB 
# 
loop_
_chem_comp_atom.comp_id 
_chem_comp_atom.atom_id 
_chem_comp_atom.alt_atom_id 
_chem_comp_atom.type_symbol 
_chem_comp_atom.charge 
_chem_comp_atom.pdbx_align 
_chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag 
_chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag 
_chem_comp_atom.pdbx_stereo_config 
_chem_comp_atom.pdbx_n_terminal_atom_flag 
_chem_comp_atom.pdbx_backbone_atom_flag 
_chem_comp_atom.pdbx_c_terminal_atom_flag 
_chem_comp_atom.model_Cartn_x 
_chem_comp_atom.model_Cartn_y 
_chem_comp_atom.model_Cartn_z 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id 
_chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id 
_chem_comp_atom.pdbx_ordinal 
QOJ C1   C1  C 0 1 Y N N N N N 89.492 -5.367  2.772 -6.739  2.249  0.729  C1   QOJ 1  
QOJ N1   N1  N 1 1 Y N N N N N 90.047 -6.458  5.063 -6.784  -0.136 0.640  N1   QOJ 2  
QOJ C2   C2  C 0 1 Y N N N N N 89.904 -4.518  1.679 -7.356  3.431  0.456  C2   QOJ 3  
QOJ N2   N2  N 1 1 Y N N N N N 81.437 -14.363 4.967 6.810   -0.118 -0.697 N2   QOJ 4  
QOJ C3   C3  C 0 1 Y N N N N N 91.186 -3.877  1.644 -8.605  3.465  -0.158 C3   QOJ 5  
QOJ N3   N3  N 0 1 N N N N N N 77.148 -14.243 3.779 10.531  -0.220 1.137  N3   QOJ 6  
QOJ C4   C4  C 0 1 Y N N N N N 92.121 -4.048  2.695 -9.244  2.312  -0.504 C4   QOJ 7  
QOJ N4   N4  N 0 1 N N N N N N 94.047 -4.507  5.040 -10.507 -0.159 -1.194 N4   QOJ 8  
QOJ C5   C5  C 0 1 Y N N N N N 90.334 -5.642  3.922 -7.368  1.039  0.388  C5   QOJ 9  
QOJ C6   C6  C 0 1 Y N N N N N 91.746 -4.943  3.898 -8.637  1.077  -0.238 C6   QOJ 10 
QOJ C7   C7  C 0 1 Y N N N N N 92.706 -5.158  5.044 -9.264  -0.144 -0.579 C7   QOJ 11 
QOJ C8   C8  C 0 1 Y N N N N N 92.285 -6.047  6.200 -8.601  -1.325 -0.281 C8   QOJ 12 
QOJ C9   C9  C 0 1 Y N N N N N 90.991 -6.664  6.182 -7.357  -1.284 0.334  C9   QOJ 13 
QOJ C10  C10 C 0 1 Y N N N N N 79.345 -15.589 4.157 8.654   1.056  0.247  C10  QOJ 14 
QOJ C11  C11 C 0 1 Y N N N N N 80.863 -15.617 4.580 7.387   1.045  -0.383 C11  QOJ 15 
QOJ C12  C12 C 0 1 Y N N N N N 80.682 -13.087 4.985 7.381   -1.278 -0.439 C12  QOJ 16 
QOJ C13  C13 C 0 1 Y N N N N N 79.300 -13.023 4.606 8.626   -1.345 0.173  C13  QOJ 17 
QOJ C14  C14 C 0 1 Y N N N N N 78.584 -14.286 4.176 9.289   -0.178 0.522  C14  QOJ 18 
QOJ C15  C15 C 0 1 Y N N N N N 78.660 -16.905 3.729 9.252   2.278  0.586  C15  QOJ 19 
QOJ C16  C16 C 0 1 Y N N N N N 79.411 -18.104 3.728 8.605   3.444  0.305  C16  QOJ 20 
QOJ C17  C17 C 0 1 Y N N N N N 80.791 -18.119 4.115 7.368   3.438  -0.335 C17  QOJ 21 
QOJ C18  C18 C 0 1 Y N N N N N 81.494 -16.926 4.524 6.756   2.268  -0.668 C18  QOJ 22 
QOJ C19  C19 C 0 1 N N N N N N 82.843 -14.328 5.370 5.496   -0.104 -1.345 C19  QOJ 23 
QOJ C20  C20 C 0 1 N N N N N N 83.736 -14.059 4.137 4.400   -0.125 -0.277 C20  QOJ 24 
QOJ C21  C21 C 0 1 N N N N N N 84.460 -12.704 4.269 3.028   -0.111 -0.954 C21  QOJ 25 
QOJ C22  C22 C 0 1 N N N N N N 85.701 -12.662 3.355 1.933   -0.131 0.114  C22  QOJ 26 
QOJ C23  C23 C 0 1 N N N N N N 86.086 -11.193 3.039 0.561   -0.117 -0.563 C23  QOJ 27 
QOJ C24  C24 C 0 1 N N N N N N 87.614 -11.015 3.068 -0.535  -0.138 0.505  C24  QOJ 28 
QOJ C25  C25 C 0 1 N N N N N N 88.103 -10.892 4.521 -1.907  -0.123 -0.172 C25  QOJ 29 
QOJ C26  C26 C 0 1 N N N N N N 87.839 -9.473  5.049 -3.003  -0.144 0.896  C26  QOJ 30 
QOJ C27  C27 C 0 1 N N N N N N 88.868 -8.501  4.458 -4.375  -0.130 0.220  C27  QOJ 31 
QOJ C28  C28 C 0 1 N N N N N N 88.754 -7.131  5.138 -5.470  -0.150 1.287  C28  QOJ 32 
QOJ C29  C29 C 0 1 N N N N N N 81.132 -11.755 5.353 6.879   -2.682 -0.714 C29  QOJ 33 
QOJ C30  C30 C 0 1 N N N N N N 90.824 -7.456  7.388 -6.851  -2.699 0.543  C30  QOJ 34 
QOJ C31  C31 C 0 1 N N N N N N 92.089 -7.326  8.206 -8.097  -3.599 0.410  C31  QOJ 35 
QOJ C32  C32 C 0 1 N N N N N N 92.993 -6.419  7.408 -9.010  -2.762 -0.519 C32  QOJ 36 
QOJ C33  C33 C 0 1 N N N N N N 79.964 -10.809 5.193 7.733   -3.602 0.183  C33  QOJ 37 
QOJ C34  C34 C 0 1 N N N N N N 78.815 -11.661 4.715 9.036   -2.791 0.348  C34  QOJ 38 
QOJ H11  H1  H 0 1 N N N N N N 88.512 -5.818  2.732 -5.768  2.240  1.202  H11  QOJ 39 
QOJ H21  H2  H 0 1 N N N N N N 89.221 -4.360  0.857 -6.869  4.358  0.722  H21  QOJ 40 
QOJ H31  H3  H 0 1 N N N N N N 91.444 -3.253  0.801 -9.073  4.416  -0.363 H31  QOJ 41 
QOJ HN32 H4  H 0 0 N N N N N N 76.810 -13.305 3.852 10.977  0.605  1.385  HN32 QOJ 42 
QOJ HN31 H5  H 0 0 N N N N N N 77.054 -14.559 2.835 10.953  -1.074 1.319  HN31 QOJ 43 
QOJ H41  H6  H 0 1 N N N N N N 93.083 -3.559  2.656 -10.212 2.349  -0.981 H41  QOJ 44 
QOJ HN42 H7  H 0 0 N N N N N N 94.543 -4.759  5.871 -10.959 0.675  -1.395 HN42 QOJ 45 
QOJ HN41 H8  H 0 0 N N N N N N 94.562 -4.811  4.239 -10.925 -1.004 -1.422 HN41 QOJ 46 
QOJ H151 H9  H 0 0 N N N N N N 77.621 -16.910 3.434 10.218  2.295  1.067  H151 QOJ 47 
QOJ H161 H10 H 0 0 N N N N N N 78.935 -19.026 3.430 9.066   4.386  0.566  H161 QOJ 48 
QOJ H171 H11 H 0 0 N N N N N N 81.325 -19.058 4.100 6.875   4.375  -0.548 H171 QOJ 49 
QOJ H181 H12 H 0 0 N N N N N N 82.535 -17.009 4.801 5.790   2.280  -1.149 H181 QOJ 50 
QOJ H192 H13 H 0 0 N N N N N N 83.119 -15.295 5.816 5.398   0.798  -1.949 H192 QOJ 51 
QOJ H191 H14 H 0 0 N N N N N N 82.991 -13.527 6.109 5.397   -0.982 -1.985 H191 QOJ 52 
QOJ H202 H15 H 0 0 N N N N N N 83.109 -14.046 3.234 4.498   -1.028 0.326  H202 QOJ 53 
QOJ H201 H16 H 0 0 N N N N N N 84.484 -14.861 4.052 4.499   0.752  0.362  H201 QOJ 54 
QOJ H212 H17 H 0 0 N N N N N N 84.775 -12.562 5.313 2.930   0.792  -1.558 H212 QOJ 55 
QOJ H211 H18 H 0 0 N N N N N N 83.771 -11.896 3.981 2.929   -0.988 -1.593 H211 QOJ 56 
QOJ H222 H19 H 0 0 N N N N N N 85.478 -13.189 2.416 2.031   -1.034 0.717  H222 QOJ 57 
QOJ H221 H20 H 0 0 N N N N N N 86.542 -13.157 3.862 2.032   0.746  0.753  H221 QOJ 58 
QOJ H232 H21 H 0 0 N N N N N N 85.631 -10.530 3.790 0.463   0.785  -1.166 H232 QOJ 59 
QOJ H231 H22 H 0 0 N N N N N N 85.710 -10.928 2.040 0.461   -0.994 -1.202 H231 QOJ 60 
QOJ H241 H23 H 0 0 N N N N N N 88.091 -11.886 2.596 -0.437  -1.040 1.109  H241 QOJ 61 
QOJ H242 H24 H 0 0 N N N N N N 87.885 -10.104 2.514 -0.436  0.739  1.144  H242 QOJ 62 
QOJ H251 H25 H 0 0 N N N N N N 87.566 -11.619 5.148 -2.005  0.779  -0.775 H251 QOJ 63 
QOJ H252 H26 H 0 0 N N N N N N 89.182 -11.100 4.560 -2.006  -1.000 -0.811 H252 QOJ 64 
QOJ H262 H27 H 0 0 N N N N N N 87.921 -9.470  6.146 -2.905  -1.046 1.500  H262 QOJ 65 
QOJ H261 H28 H 0 0 N N N N N N 86.827 -9.156  4.756 -2.904  0.733  1.536  H261 QOJ 66 
QOJ H271 H29 H 0 0 N N N N N N 89.880 -8.902  4.617 -4.473  0.773  -0.384 H271 QOJ 67 
QOJ H272 H30 H 0 0 N N N N N N 88.683 -8.388  3.380 -4.474  -1.007 -0.420 H272 QOJ 68 
QOJ H281 H31 H 0 0 N N N N N N 87.992 -6.526  4.625 -5.371  0.727  1.927  H281 QOJ 69 
QOJ H282 H32 H 0 0 N N N N N N 88.467 -7.264  6.192 -5.372  -1.053 1.891  H282 QOJ 70 
QOJ H291 H33 H 0 0 N N N N N N 81.475 -11.752 6.398 5.825   -2.766 -0.447 H291 QOJ 71 
QOJ H292 H34 H 0 0 N N N N N N 81.957 -11.444 4.695 7.023   -2.936 -1.764 H292 QOJ 72 
QOJ H301 H35 H 0 0 N N N N N N 89.965 -7.082  7.965 -6.118  -2.954 -0.222 H301 QOJ 73 
QOJ H302 H36 H 0 0 N N N N N N 90.657 -8.510  7.123 -6.415  -2.802 1.536  H302 QOJ 74 
QOJ H311 H37 H 0 0 N N N N N N 91.868 -6.882  9.188 -7.841  -4.548 -0.062 H311 QOJ 75 
QOJ H312 H38 H 0 0 N N N N N N 92.559 -8.311  8.346 -8.561  -3.764 1.383  H312 QOJ 76 
QOJ H322 H39 H 0 0 N N N N N N 93.922 -6.948  7.150 -10.057 -2.907 -0.249 H322 QOJ 77 
QOJ H321 H40 H 0 0 N N N N N N 93.234 -5.520  7.994 -8.846  -3.035 -1.561 H321 QOJ 78 
QOJ H332 H41 H 0 0 N N N N N N 80.199 -10.031 4.452 7.250   -3.759 1.148  H332 QOJ 79 
QOJ H331 H42 H 0 0 N N N N N N 79.718 -10.337 6.155 7.926   -4.554 -0.311 H331 QOJ 80 
QOJ H342 H43 H 0 0 N N N N N N 78.467 -11.306 3.734 9.757   -3.075 -0.419 H342 QOJ 81 
QOJ H341 H44 H 0 0 N N N N N N 77.986 -11.614 5.437 9.456   -2.948 1.341  H341 QOJ 82 
# 
loop_
_chem_comp_bond.comp_id 
_chem_comp_bond.atom_id_1 
_chem_comp_bond.atom_id_2 
_chem_comp_bond.value_order 
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag 
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config 
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal 
QOJ C3  C2   DOUB Y N 1  
QOJ C3  C4   SING Y N 2  
QOJ C2  C1   SING Y N 3  
QOJ C4  C6   DOUB Y N 4  
QOJ C1  C5   DOUB Y N 5  
QOJ C23 C24  SING N N 6  
QOJ C23 C22  SING N N 7  
QOJ C24 C25  SING N N 8  
QOJ C22 C21  SING N N 9  
QOJ C16 C15  DOUB Y N 10 
QOJ C16 C17  SING Y N 11 
QOJ C15 C10  SING Y N 12 
QOJ N3  C14  SING N N 13 
QOJ C6  C5   SING Y N 14 
QOJ C6  C7   SING Y N 15 
QOJ C5  N1   SING Y N 16 
QOJ C17 C18  DOUB Y N 17 
QOJ C20 C21  SING N N 18 
QOJ C20 C19  SING N N 19 
QOJ C10 C14  DOUB Y N 20 
QOJ C10 C11  SING Y N 21 
QOJ C14 C13  SING Y N 22 
QOJ C27 C26  SING N N 23 
QOJ C27 C28  SING N N 24 
QOJ C25 C26  SING N N 25 
QOJ C18 C11  SING Y N 26 
QOJ C11 N2   DOUB Y N 27 
QOJ C13 C34  SING N N 28 
QOJ C13 C12  DOUB Y N 29 
QOJ C34 C33  SING N N 30 
QOJ N2  C12  SING Y N 31 
QOJ N2  C19  SING N N 32 
QOJ C12 C29  SING N N 33 
QOJ N4  C7   SING N N 34 
QOJ C7  C8   DOUB Y N 35 
QOJ N1  C28  SING N N 36 
QOJ N1  C9   DOUB Y N 37 
QOJ C33 C29  SING N N 38 
QOJ C9  C8   SING Y N 39 
QOJ C9  C30  SING N N 40 
QOJ C8  C32  SING N N 41 
QOJ C30 C31  SING N N 42 
QOJ C32 C31  SING N N 43 
QOJ C1  H11  SING N N 44 
QOJ C2  H21  SING N N 45 
QOJ C3  H31  SING N N 46 
QOJ N3  HN32 SING N N 47 
QOJ N3  HN31 SING N N 48 
QOJ C4  H41  SING N N 49 
QOJ N4  HN42 SING N N 50 
QOJ N4  HN41 SING N N 51 
QOJ C15 H151 SING N N 52 
QOJ C16 H161 SING N N 53 
QOJ C17 H171 SING N N 54 
QOJ C18 H181 SING N N 55 
QOJ C19 H192 SING N N 56 
QOJ C19 H191 SING N N 57 
QOJ C20 H202 SING N N 58 
QOJ C20 H201 SING N N 59 
QOJ C21 H212 SING N N 60 
QOJ C21 H211 SING N N 61 
QOJ C22 H222 SING N N 62 
QOJ C22 H221 SING N N 63 
QOJ C23 H232 SING N N 64 
QOJ C23 H231 SING N N 65 
QOJ C24 H241 SING N N 66 
QOJ C24 H242 SING N N 67 
QOJ C25 H251 SING N N 68 
QOJ C25 H252 SING N N 69 
QOJ C26 H262 SING N N 70 
QOJ C26 H261 SING N N 71 
QOJ C27 H271 SING N N 72 
QOJ C27 H272 SING N N 73 
QOJ C28 H281 SING N N 74 
QOJ C28 H282 SING N N 75 
QOJ C29 H291 SING N N 76 
QOJ C29 H292 SING N N 77 
QOJ C30 H301 SING N N 78 
QOJ C30 H302 SING N N 79 
QOJ C31 H311 SING N N 80 
QOJ C31 H312 SING N N 81 
QOJ C32 H322 SING N N 82 
QOJ C32 H321 SING N N 83 
QOJ C33 H332 SING N N 84 
QOJ C33 H331 SING N N 85 
QOJ C34 H342 SING N N 86 
QOJ C34 H341 SING N N 87 
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id 
_pdbx_chem_comp_descriptor.type 
_pdbx_chem_comp_descriptor.program 
_pdbx_chem_comp_descriptor.program_version 
_pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor 
QOJ SMILES           ACDLabs              12.01 "Nc1c2ccccc2[n+](CCCCCCCCCC[n+]2c3ccccc3c(N)c3CCCc23)c2CCCc12"                                                                                                                                       
QOJ InChI            InChI                1.06  "InChI=1S/C34H42N4/c35-33-25-15-7-9-19-29(25)37(31-21-13-17-27(31)33)23-11-5-3-1-2-4-6-12-24-38-30-20-10-8-16-26(30)34(36)28-18-14-22-32(28)38/h7-10,15-16,19-20,35-36H,1-6,11-14,17-18,21-24H2/p+2" 
QOJ InChIKey         InChI                1.06  MEFIQYBUDHNVHT-UHFFFAOYSA-P                                                                                                                                                                          
QOJ SMILES_CANONICAL CACTVS               3.385 "Nc1c2CCCc2[n+](CCCCCCCCCC[n+]3c4CCCc4c(N)c5ccccc35)c6ccccc16"                                                                                                                                       
QOJ SMILES           CACTVS               3.385 "Nc1c2CCCc2[n+](CCCCCCCCCC[n+]3c4CCCc4c(N)c5ccccc35)c6ccccc16"                                                                                                                                       
QOJ SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 2.0.7 "c1ccc2c(c1)c(c3c([n+]2CCCCCCCCCC[n+]4c5ccccc5c(c6c4CCC6)N)CCC3)N"                                                                                                                                   
QOJ SMILES           "OpenEye OEToolkits" 2.0.7 "c1ccc2c(c1)c(c3c([n+]2CCCCCCCCCC[n+]4c5ccccc5c(c6c4CCC6)N)CCC3)N"                                                                                                                                   
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_identifier.comp_id 
_pdbx_chem_comp_identifier.type 
_pdbx_chem_comp_identifier.program 
_pdbx_chem_comp_identifier.program_version 
_pdbx_chem_comp_identifier.identifier 
QOJ "SYSTEMATIC NAME" ACDLabs              12.01 "4,4'-(decane-1,10-diyl)bis(9-amino-2,3-dihydro-1H-cyclopenta[b]quinolin-4-ium)"                                                  
QOJ "SYSTEMATIC NAME" "OpenEye OEToolkits" 2.0.7 "4-[10-(9-azanyl-2,3-dihydro-1~{H}-cyclopenta[b]quinolin-4-ium-4-yl)decyl]-2,3-dihydro-1~{H}-cyclopenta[b]quinolin-4-ium-9-amine" 
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_audit.comp_id 
_pdbx_chem_comp_audit.action_type 
_pdbx_chem_comp_audit.date 
_pdbx_chem_comp_audit.processing_site 
QOJ "Create component"   2019-12-03 RCSB 
QOJ "Initial release"    2020-04-01 RCSB 
QOJ "Other modification" 2024-05-08 RCSB 
# 
