data_0OJ
# 
_chem_comp.id                                    0OJ 
_chem_comp.name                                  
;South-methanocarba-2'-deoxyadenosine triphosphate
;
_chem_comp.type                                  NON-POLYMER 
_chem_comp.pdbx_type                             HETAIN 
_chem_comp.formula                               "C12 H18 N5 O11 P3" 
_chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id               ? 
_chem_comp.pdbx_synonyms                         ? 
_chem_comp.pdbx_formal_charge                    0 
_chem_comp.pdbx_initial_date                     2012-04-03 
_chem_comp.pdbx_modified_date                    2012-06-08 
_chem_comp.pdbx_ambiguous_flag                   N 
_chem_comp.pdbx_release_status                   REL 
_chem_comp.pdbx_replaced_by                      ? 
_chem_comp.pdbx_replaces                         ? 
_chem_comp.formula_weight                        501.220 
_chem_comp.one_letter_code                       ? 
_chem_comp.three_letter_code                     0OJ 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_details        ? 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag   N 
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details        Corina 
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag   N 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code        4EBD 
_chem_comp.pdbx_subcomponent_list                ? 
_chem_comp.pdbx_processing_site                  RCSB 
# 
loop_
_chem_comp_atom.comp_id 
_chem_comp_atom.atom_id 
_chem_comp_atom.alt_atom_id 
_chem_comp_atom.type_symbol 
_chem_comp_atom.charge 
_chem_comp_atom.pdbx_align 
_chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag 
_chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag 
_chem_comp_atom.pdbx_stereo_config 
_chem_comp_atom.model_Cartn_x 
_chem_comp_atom.model_Cartn_y 
_chem_comp_atom.model_Cartn_z 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id 
_chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id 
_chem_comp_atom.pdbx_ordinal 
0OJ OAF OAF O 0 1 N N N 2.961  17.898 13.787 6.466  3.263  -0.506 OAF 0OJ 1  
0OJ PBC PBC P 0 1 N N N 1.542  17.800 14.249 6.688  1.791  0.108  PBC 0OJ 2  
0OJ OAG OAG O 0 1 N N N 1.163  16.345 13.995 8.043  1.159  -0.490 OAG 0OJ 3  
0OJ OAB OAB O 0 1 N N N 0.735  18.784 13.406 6.793  1.882  1.581  OAB 0OJ 4  
0OJ OAS OAS O 0 1 N N N 1.381  18.091 15.810 5.439  0.853  -0.285 OAS 0OJ 5  
0OJ PBE PBE P 0 1 N N N 2.003  19.367 16.510 4.843  -0.520 0.308  PBE 0OJ 6  
0OJ OAI OAI O 0 1 N N N 3.422  19.098 16.923 4.791  -0.438 1.784  OAI 0OJ 7  
0OJ OAD OAD O 0 1 N N N 1.194  19.742 17.725 5.787  -1.748 -0.129 OAD 0OJ 8  
0OJ OAT OAT O 0 1 N N N 1.908  20.466 15.393 3.358  -0.752 -0.270 OAT 0OJ 9  
0OJ PBD PBD P 0 1 N N N 2.071  22.011 15.633 2.102  -1.644 0.200  PBD 0OJ 10 
0OJ OAH OAH O 0 1 N N N 1.198  22.731 14.613 1.909  -1.495 1.659  OAH 0OJ 11 
0OJ OAC OAC O 0 1 N N N 3.519  22.356 15.364 2.382  -3.191 -0.149 OAC 0OJ 12 
0OJ OAR OAR O 0 1 N N N 1.632  22.400 17.116 0.777  -1.152 -0.570 OAR 0OJ 13 
0OJ CAL CAL C 0 1 N N N 2.612  22.813 18.046 -0.524 -1.677 -0.294 CAL 0OJ 14 
0OJ CAY CAY C 0 1 N N R 2.195  23.157 19.386 -1.552 -0.995 -1.199 CAY 0OJ 15 
0OJ CAZ CAZ C 0 1 N N S 2.257  24.682 19.581 -2.944 -1.631 -1.010 CAZ 0OJ 16 
0OJ CAN CAN C 0 1 N N N 1.786  25.425 20.812 -3.934 -1.564 -2.174 CAN 0OJ 17 
0OJ CAX CAX C 0 1 N N S 0.767  22.767 19.622 -1.748 0.483  -0.778 CAX 0OJ 18 
0OJ OAE OAE O 0 1 N N N 0.613  22.391 20.902 -0.762 1.319  -1.386 OAE 0OJ 19 
0OJ CAM CAM C 0 1 N N N -0.044 23.984 19.343 -3.159 0.810  -1.327 CAM 0OJ 20 
0OJ CBB CBB C 0 1 N N S 0.820  25.144 19.690 -3.966 -0.483 -1.091 CBB 0OJ 21 
0OJ N9  N9  N 0 1 Y N N 0.098  26.337 19.253 -5.104 -0.410 -0.171 N9  0OJ 22 
0OJ C8  C8  C 0 1 Y N N -0.357 27.265 20.111 -5.395 -1.295 0.824  C8  0OJ 23 
0OJ N7  N7  N 0 1 Y N N -0.979 28.225 19.402 -6.477 -0.925 1.446  N7  0OJ 24 
0OJ C5  C5  C 0 1 Y N N -0.928 27.905 18.090 -6.947 0.218  0.891  C5  0OJ 25 
0OJ C4  C4  C 0 1 Y N N -0.240 26.696 17.988 -6.069 0.565  -0.149 C4  0OJ 26 
0OJ N3  N3  N 0 1 Y N N -0.049 26.129 16.778 -6.311 1.662  -0.860 N3  0OJ 27 
0OJ C2  C2  C 0 1 Y N N -0.509 26.723 15.665 -7.358 2.415  -0.596 C2  0OJ 28 
0OJ N1  N1  N 0 1 Y N N -1.175 27.889 15.711 -8.210 2.130  0.371  N1  0OJ 29 
0OJ C6  C6  C 0 1 Y N N -1.393 28.485 16.901 -8.048 1.056  1.137  C6  0OJ 30 
0OJ N6  N6  N 0 1 N N N -2.113 29.735 16.957 -8.947 0.765  2.148  N6  0OJ 31 
0OJ H1  H1  H 0 1 N N N 3.024  18.539 13.089 7.182  3.884  -0.308 H1  0OJ 32 
0OJ H2  H2  H 0 1 N N N 0.475  16.306 13.341 8.044  1.070  -1.452 H2  0OJ 33 
0OJ H3  H3  H 0 1 N N N 1.752  19.729 18.494 5.867  -1.861 -1.086 H3  0OJ 34 
0OJ H4  H4  H 0 1 N N N 3.572  22.945 14.620 2.519  -3.363 -1.091 H4  0OJ 35 
0OJ H5  H5  H 0 1 N N N 3.341  21.994 18.134 -0.530 -2.750 -0.482 H5  0OJ 36 
0OJ H6  H6  H 0 1 N N N 3.107  23.700 17.623 -0.777 -1.490 0.749  H6  0OJ 37 
0OJ H7  H7  H 0 1 N N N 2.842  22.669 20.130 -1.242 -1.058 -2.242 H7  0OJ 38 
0OJ H8  H8  H 0 1 N N N 2.904  25.236 18.885 -3.038 -2.421 -0.265 H8  0OJ 39 
0OJ H9  H9  H 0 1 N N N 1.685  24.894 21.770 -3.542 -1.284 -3.152 H9  0OJ 40 
0OJ H10 H10 H 0 1 N N N 2.129  26.454 20.998 -4.748 -2.289 -2.185 H10 0OJ 41 
0OJ H11 H11 H 0 1 N N N 0.485  21.966 18.923 -1.721 0.582  0.307  H11 0OJ 42 
0OJ H12 H12 H 0 1 N N N 1.134  21.614 21.069 -0.841 2.254  -1.154 H12 0OJ 43 
0OJ H13 H13 H 0 1 N N N -0.324 24.021 18.280 -3.600 1.641  -0.776 H13 0OJ 44 
0OJ H14 H14 H 0 1 N N N -0.953 23.987 19.962 -3.110 1.040  -2.392 H14 0OJ 45 
0OJ H15 H15 H 0 1 N N N -0.243 27.244 21.185 -4.814 -2.174 1.061  H15 0OJ 46 
0OJ H16 H16 H 0 1 N N N -0.339 26.251 14.708 -7.527 3.298  -1.194 H16 0OJ 47 
0OJ H17 H17 H 0 1 N N N -2.373 30.012 16.032 -9.707 1.347  2.304  H17 0OJ 48 
0OJ H18 H18 H 0 1 N N N -2.935 29.621 17.515 -8.818 -0.022 2.701  H18 0OJ 49 
# 
loop_
_chem_comp_bond.comp_id 
_chem_comp_bond.atom_id_1 
_chem_comp_bond.atom_id_2 
_chem_comp_bond.value_order 
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag 
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config 
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal 
0OJ OAB PBC DOUB N N 1  
0OJ OAF PBC SING N N 2  
0OJ OAG PBC SING N N 3  
0OJ PBC OAS SING N N 4  
0OJ OAH PBD DOUB N N 5  
0OJ OAC PBD SING N N 6  
0OJ OAT PBD SING N N 7  
0OJ OAT PBE SING N N 8  
0OJ PBD OAR SING N N 9  
0OJ C2  N1  DOUB Y N 10 
0OJ C2  N3  SING Y N 11 
0OJ N1  C6  SING Y N 12 
0OJ OAS PBE SING N N 13 
0OJ PBE OAI DOUB N N 14 
0OJ PBE OAD SING N N 15 
0OJ N3  C4  DOUB Y N 16 
0OJ C6  N6  SING N N 17 
0OJ C6  C5  DOUB Y N 18 
0OJ OAR CAL SING N N 19 
0OJ C4  C5  SING Y N 20 
0OJ C4  N9  SING Y N 21 
0OJ CAL CAY SING N N 22 
0OJ C5  N7  SING Y N 23 
0OJ N9  CBB SING N N 24 
0OJ N9  C8  SING Y N 25 
0OJ CAM CAX SING N N 26 
0OJ CAM CBB SING N N 27 
0OJ CAY CAZ SING N N 28 
0OJ CAY CAX SING N N 29 
0OJ N7  C8  DOUB Y N 30 
0OJ CAZ CBB SING N N 31 
0OJ CAZ CAN SING N N 32 
0OJ CAX OAE SING N N 33 
0OJ CBB CAN SING N N 34 
0OJ OAF H1  SING N N 35 
0OJ OAG H2  SING N N 36 
0OJ OAD H3  SING N N 37 
0OJ OAC H4  SING N N 38 
0OJ CAL H5  SING N N 39 
0OJ CAL H6  SING N N 40 
0OJ CAY H7  SING N N 41 
0OJ CAZ H8  SING N N 42 
0OJ CAN H9  SING N N 43 
0OJ CAN H10 SING N N 44 
0OJ CAX H11 SING N N 45 
0OJ OAE H12 SING N N 46 
0OJ CAM H13 SING N N 47 
0OJ CAM H14 SING N N 48 
0OJ C8  H15 SING N N 49 
0OJ C2  H16 SING N N 50 
0OJ N6  H17 SING N N 51 
0OJ N6  H18 SING N N 52 
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id 
_pdbx_chem_comp_descriptor.type 
_pdbx_chem_comp_descriptor.program 
_pdbx_chem_comp_descriptor.program_version 
_pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor 
0OJ InChI            InChI                1.03  "InChI=1S/C12H18N5O11P3/c13-10-9-11(15-4-14-10)17(5-16-9)12-1-7(12)6(8(18)2-12)3-26-30(22,23)28-31(24,25)27-29(19,20)21/h4-8,18H,1-3H2,(H,22,23)(H,24,25)(H2,13,14,15)(H2,19,20,21)/t6-,7-,8-,12-/m0/s1" 
0OJ InChIKey         InChI                1.03  DNBZILMJAUSGHT-QZOVBDONSA-N                                                                                                                                                                              
0OJ SMILES_CANONICAL CACTVS               3.370 "Nc1ncnc2n(cnc12)[C@@]34C[C@H](O)[C@@H](CO[P](O)(=O)O[P](O)(=O)O[P](O)(O)=O)[C@@H]3C4"                                                                                                                   
0OJ SMILES           CACTVS               3.370 "Nc1ncnc2n(cnc12)[C]34C[CH](O)[CH](CO[P](O)(=O)O[P](O)(=O)O[P](O)(O)=O)[CH]3C4"                                                                                                                          
0OJ SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 1.7.6 "c1nc(c2c(n1)n(cn2)[C@]34C[C@H]3[C@@H]([C@H](C4)O)COP(=O)(O)OP(=O)(O)OP(=O)(O)O)N"                                                                                                                       
0OJ SMILES           "OpenEye OEToolkits" 1.7.6 "c1nc(c2c(n1)n(cn2)C34CC3C(C(C4)O)COP(=O)(O)OP(=O)(O)OP(=O)(O)O)N"                                                                                                                                       
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_identifier.comp_id 
_pdbx_chem_comp_identifier.type 
_pdbx_chem_comp_identifier.program 
_pdbx_chem_comp_identifier.program_version 
_pdbx_chem_comp_identifier.identifier 
0OJ "SYSTEMATIC NAME" "OpenEye OEToolkits" 1.7.6 "[[(1S,2R,3S,5S)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3-oxidanyl-2-bicyclo[3.1.0]hexanyl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate" 
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_audit.comp_id 
_pdbx_chem_comp_audit.action_type 
_pdbx_chem_comp_audit.date 
_pdbx_chem_comp_audit.processing_site 
0OJ "Create component" 2012-04-03 RCSB 
# 
