data_A1H52
# 
_chem_comp.id                                    A1H52 
_chem_comp.name                                  "7.10 monoacylglycerol (R-form)" 
_chem_comp.type                                  non-polymer 
_chem_comp.pdbx_type                             HETAIN 
_chem_comp.formula                               "C20 H38 O4" 
_chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id               ? 
_chem_comp.pdbx_synonyms                         "[(2R)-2,3-bis(oxidanyl)propyl] (E)-heptadec-7-enoate" 
_chem_comp.pdbx_formal_charge                    0 
_chem_comp.pdbx_initial_date                     2024-03-11 
_chem_comp.pdbx_modified_date                    2024-03-29 
_chem_comp.pdbx_ambiguous_flag                   N 
_chem_comp.pdbx_release_status                   REL 
_chem_comp.pdbx_replaced_by                      ? 
_chem_comp.pdbx_replaces                         ? 
_chem_comp.formula_weight                        342.513 
_chem_comp.one_letter_code                       ? 
_chem_comp.three_letter_code                     A1H52 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_details        ? 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag   N 
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details        Corina 
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag   N 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code        8RQP 
_chem_comp.pdbx_subcomponent_list                ? 
_chem_comp.pdbx_processing_site                  PDBE 
# 
loop_
_chem_comp_atom.comp_id 
_chem_comp_atom.atom_id 
_chem_comp_atom.alt_atom_id 
_chem_comp_atom.type_symbol 
_chem_comp_atom.charge 
_chem_comp_atom.pdbx_align 
_chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag 
_chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag 
_chem_comp_atom.pdbx_stereo_config 
_chem_comp_atom.pdbx_n_terminal_atom_flag 
_chem_comp_atom.pdbx_backbone_atom_flag 
_chem_comp_atom.pdbx_c_terminal_atom_flag 
_chem_comp_atom.model_Cartn_x 
_chem_comp_atom.model_Cartn_y 
_chem_comp_atom.model_Cartn_z 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id 
_chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id 
_chem_comp_atom.pdbx_ordinal 
A1H52 O1  O1  O 0 1 N N N N N N -9.348 5.304  25.171 10.872  2.362  -0.489 O1  A1H52 1  
A1H52 C1  C1  C 0 1 N N N N N N -8.627 4.913  26.329 9.586   2.386  0.134  C1  A1H52 2  
A1H52 C2  C2  C 0 1 N N R N N N -8.241 5.994  27.334 8.775   1.171  -0.322 C2  A1H52 3  
A1H52 O2  O2  O 0 1 N N N N N N -8.550 5.830  28.650 9.401   -0.024 0.149  O2  A1H52 4  
A1H52 C3  C3  C 0 1 N N N N N N -6.929 6.654  26.932 7.357   1.262  0.245  C3  A1H52 5  
A1H52 O3  O3  O 0 1 N N N N N N -6.160 6.712  28.162 6.554   0.174  -0.283 O3  A1H52 6  
A1H52 C4  C4  C 0 1 N N N N N N -4.958 7.295  28.121 5.275   0.110  0.120  C4  A1H52 7  
A1H52 O4  O4  O 0 1 N N N N N N -4.580 7.961  27.182 4.841   0.935  0.888  O4  A1H52 8  
A1H52 C5  C5  C 0 1 N N N N N N -4.149 6.842  29.306 4.381   -0.993 -0.386 C5  A1H52 9  
A1H52 C6  C6  C 0 1 N N N N N N -3.121 7.821  29.825 2.985   -0.836 0.222  C6  A1H52 10 
A1H52 C7  C7  C 0 1 N N N N N N -1.872 7.865  28.967 2.077   -1.955 -0.292 C7  A1H52 11 
A1H52 C8  C8  C 0 1 N N N N N N -1.219 9.240  28.961 0.682   -1.799 0.316  C8  A1H52 12 
A1H52 C9  C9  C 0 1 N N N N N N -0.530 9.619  30.269 -0.227  -2.918 -0.197 C9  A1H52 13 
A1H52 C10 C10 C 0 1 N N N N N N -0.806 11.040 30.654 -1.601  -2.764 0.401  C10 A1H52 14 
A1H52 C11 C11 C 0 1 N N N N N N -1.343 11.423 31.799 -2.651  -2.691 -0.379 C11 A1H52 15 
A1H52 C12 C12 C 0 1 N N N N N N -1.683 12.833 32.156 -4.025  -2.537 0.220  C12 A1H52 16 
A1H52 C13 C13 C 0 1 N N N N N N -0.689 13.520 33.098 -4.707  -1.306 -0.378 C13 A1H52 17 
A1H52 C14 C14 C 0 1 N N N N N N -1.111 14.936 33.465 -6.102  -1.149 0.230  C14 A1H52 18 
A1H52 C15 C15 C 0 1 N N N N N N 0.011  15.862 33.910 -6.785  0.083  -0.369 C15 A1H52 19 
A1H52 C16 C16 C 0 1 N N N N N N 0.697  15.528 35.226 -8.180  0.239  0.239  C16 A1H52 20 
A1H52 C17 C17 C 0 1 N N N N N N 1.746  14.425 35.193 -8.862  1.471  -0.359 C17 A1H52 21 
A1H52 C18 C18 C 0 1 N N N N N N 2.575  14.350 36.471 -10.257 1.627  0.249  C18 A1H52 22 
A1H52 C19 C19 C 0 1 N N N N N N 1.836  14.765 37.737 -10.939 2.859  -0.350 C19 A1H52 23 
A1H52 C20 C20 C 0 1 N N N N N N 2.623  14.526 39.007 -12.335 3.015  0.258  C20 A1H52 24 
A1H52 H1  H1  H 0 1 N N N N N N -9.523 4.540  24.634 11.441  3.104  -0.245 H1  A1H52 25 
A1H52 H2  H2  H 0 1 N N N N N N -9.243 4.175  26.864 9.707   2.357  1.217  H2  A1H52 26 
A1H52 H3  H3  H 0 1 N N N N N N -7.696 4.436  25.989 9.063   3.299  -0.149 H3  A1H52 27 
A1H52 H4  H4  H 0 1 N N N N N N -8.949 6.785  27.045 8.731   1.153  -1.411 H4  A1H52 28 
A1H52 H5  H5  H 0 1 N N N N N N -8.246 6.583  29.143 9.475   -0.075 1.112  H5  A1H52 29 
A1H52 H6  H6  H 0 1 N N N N N N -6.406 6.051  26.175 7.396   1.192  1.332  H6  A1H52 30 
A1H52 H7  H7  H 0 1 N N N N N N -7.107 7.665  26.537 6.912   2.215  -0.042 H7  A1H52 31 
A1H52 H8  H8  H 0 1 N N N N N N -4.849 6.623  30.126 4.312   -0.935 -1.472 H8  A1H52 32 
A1H52 H9  H9  H 0 1 N N N N N N -3.621 5.921  29.019 4.796   -1.958 -0.099 H9  A1H52 33 
A1H52 H11 H10 H 0 1 N N N N N N -2.837 7.525  30.846 3.054   -0.894 1.308  H11 A1H52 34 
A1H52 H10 H11 H 0 1 N N N N N N -3.570 8.825  29.846 2.570   0.130  -0.065 H10 A1H52 35 
A1H52 H13 H12 H 0 1 N N N N N N -2.143 7.598  27.935 2.009   -1.898 -1.378 H13 A1H52 36 
A1H52 H12 H13 H 0 1 N N N N N N -1.150 7.133  29.357 2.493   -2.921 -0.004 H12 A1H52 37 
A1H52 H14 H14 H 0 1 N N N N N N -0.467 9.260  28.158 0.750   -1.857 1.403  H14 A1H52 38 
A1H52 H15 H15 H 0 1 N N N N N N -1.997 9.989  28.753 0.266   -0.833 0.029  H15 A1H52 39 
A1H52 H16 H16 H 0 1 N N N N N N -0.895 8.957  31.068 -0.295  -2.861 -1.284 H16 A1H52 40 
A1H52 H17 H17 H 0 1 N N N N N N 0.556  9.487  30.150 0.189   -3.884 0.090  H17 A1H52 41 
A1H52 H18 H18 H 0 1 N N N N N N -0.547 11.810 29.942 -1.720  -2.714 1.474  H18 A1H52 42 
A1H52 H19 H19 H 0 1 N N N N N N -1.552 10.658 32.533 -2.532  -2.741 -1.451 H19 A1H52 43 
A1H52 H20 H20 H 0 1 N N N N N N -1.732 13.418 31.226 -4.619  -3.425 -0.000 H20 A1H52 44 
A1H52 H21 H21 H 0 1 N N N N N N -2.670 12.834 32.642 -3.940  -2.417 1.300  H21 A1H52 45 
A1H52 H22 H22 H 0 1 N N N N N N -0.610 12.926 34.020 -4.113  -0.419 -0.158 H22 A1H52 46 
A1H52 H23 H23 H 0 1 N N N N N N 0.293  13.562 32.604 -4.793  -1.426 -1.458 H23 A1H52 47 
A1H52 H24 H24 H 0 1 N N N N N N -1.591 15.385 32.583 -6.696  -2.036 0.009  H24 A1H52 48 
A1H52 H25 H25 H 0 1 N N N N N N -1.841 14.870 34.286 -6.017  -1.029 1.310  H25 A1H52 49 
A1H52 H26 H26 H 0 1 N N N N N N 0.780  15.855 33.123 -6.191  0.970  -0.148 H26 A1H52 50 
A1H52 H27 H27 H 0 1 N N N N N N -0.410 16.874 34.002 -6.870  -0.038 -1.449 H27 A1H52 51 
A1H52 H28 H28 H 0 1 N N N N N N 1.188  16.444 35.587 -8.774  -0.648 0.019  H28 A1H52 52 
A1H52 H29 H29 H 0 1 N N N N N N -0.083 15.224 35.940 -8.094  0.359  1.319  H29 A1H52 53 
A1H52 H30 H30 H 0 1 N N N N N N 1.236  13.461 35.049 -8.268  2.358  -0.139 H30 A1H52 54 
A1H52 H31 H31 H 0 1 N N N N N N 2.423  14.611 34.347 -8.948  1.350  -1.439 H31 A1H52 55 
A1H52 H32 H32 H 0 1 N N N N N N 2.915  13.312 36.598 -10.851 0.740  0.028  H32 A1H52 56 
A1H52 H33 H33 H 0 1 N N N N N N 3.447  15.009 36.352 -10.172 1.748  1.329  H33 A1H52 57 
A1H52 H34 H34 H 0 1 N N N N N N 1.605  15.838 37.668 -10.346 3.746  -0.129 H34 A1H52 58 
A1H52 H35 H35 H 0 1 N N N N N N 0.899  14.192 37.796 -11.025 2.738  -1.429 H35 A1H52 59 
A1H52 H37 H36 H 0 1 N N N N N N 2.028  14.848 39.874 -12.928 2.128  0.038  H37 A1H52 60 
A1H52 H36 H37 H 0 1 N N N N N N 2.854  13.454 39.099 -12.249 3.136  1.338  H36 A1H52 61 
A1H52 H38 H38 H 0 1 N N N N N N 3.560  15.101 38.971 -12.821 3.892  -0.168 H38 A1H52 62 
# 
loop_
_chem_comp_bond.comp_id 
_chem_comp_bond.atom_id_1 
_chem_comp_bond.atom_id_2 
_chem_comp_bond.value_order 
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag 
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config 
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal 
A1H52 O1  C1  SING N N 1  
A1H52 C1  C2  SING N N 2  
A1H52 C3  C2  SING N N 3  
A1H52 C3  O3  SING N N 4  
A1H52 O4  C4  DOUB N N 5  
A1H52 C2  O2  SING N N 6  
A1H52 C4  O3  SING N N 7  
A1H52 C4  C5  SING N N 8  
A1H52 C8  C7  SING N N 9  
A1H52 C8  C9  SING N N 10 
A1H52 C7  C6  SING N N 11 
A1H52 C5  C6  SING N N 12 
A1H52 C9  C10 SING N N 13 
A1H52 C10 C11 DOUB N E 14 
A1H52 C11 C12 SING N N 15 
A1H52 C12 C13 SING N N 16 
A1H52 C13 C14 SING N N 17 
A1H52 C14 C15 SING N N 18 
A1H52 C15 C16 SING N N 19 
A1H52 C17 C16 SING N N 20 
A1H52 C17 C18 SING N N 21 
A1H52 C18 C19 SING N N 22 
A1H52 C19 C20 SING N N 23 
A1H52 O1  H1  SING N N 24 
A1H52 C1  H2  SING N N 25 
A1H52 C1  H3  SING N N 26 
A1H52 C2  H4  SING N N 27 
A1H52 O2  H5  SING N N 28 
A1H52 C3  H6  SING N N 29 
A1H52 C3  H7  SING N N 30 
A1H52 C5  H8  SING N N 31 
A1H52 C5  H9  SING N N 32 
A1H52 C6  H11 SING N N 33 
A1H52 C6  H10 SING N N 34 
A1H52 C7  H13 SING N N 35 
A1H52 C7  H12 SING N N 36 
A1H52 C8  H14 SING N N 37 
A1H52 C8  H15 SING N N 38 
A1H52 C9  H16 SING N N 39 
A1H52 C9  H17 SING N N 40 
A1H52 C10 H18 SING N N 41 
A1H52 C11 H19 SING N N 42 
A1H52 C12 H20 SING N N 43 
A1H52 C12 H21 SING N N 44 
A1H52 C13 H22 SING N N 45 
A1H52 C13 H23 SING N N 46 
A1H52 C14 H24 SING N N 47 
A1H52 C14 H25 SING N N 48 
A1H52 C15 H26 SING N N 49 
A1H52 C15 H27 SING N N 50 
A1H52 C16 H28 SING N N 51 
A1H52 C16 H29 SING N N 52 
A1H52 C17 H30 SING N N 53 
A1H52 C17 H31 SING N N 54 
A1H52 C18 H32 SING N N 55 
A1H52 C18 H33 SING N N 56 
A1H52 C19 H34 SING N N 57 
A1H52 C19 H35 SING N N 58 
A1H52 C20 H37 SING N N 59 
A1H52 C20 H36 SING N N 60 
A1H52 C20 H38 SING N N 61 
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id 
_pdbx_chem_comp_descriptor.type 
_pdbx_chem_comp_descriptor.program 
_pdbx_chem_comp_descriptor.program_version 
_pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor 
A1H52 InChI            InChI                1.06  "InChI=1S/C20H38O4/c1-2-3-4-5-6-7-8-9-10-11-12-13-14-15-16-20(23)24-18-19(22)17-21/h10-11,19,21-22H,2-9,12-18H2,1H3/b11-10+/t19-/m1/s1" 
A1H52 InChIKey         InChI                1.06  XTALOCBNHVPVKU-GNISGLHKSA-N                                                                                                             
A1H52 SMILES_CANONICAL CACTVS               3.385 "CCCCCCCCC/C=C/CCCCCC(=O)OC[C@H](O)CO"                                                                                                  
A1H52 SMILES           CACTVS               3.385 "CCCCCCCCCC=CCCCCCC(=O)OC[CH](O)CO"                                                                                                     
A1H52 SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 2.0.7 "CCCCCCCCC/C=C/CCCCCC(=O)OC[C@@H](CO)O"                                                                                                 
A1H52 SMILES           "OpenEye OEToolkits" 2.0.7 "CCCCCCCCCC=CCCCCCC(=O)OCC(CO)O"                                                                                                        
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A1H52 "Create component" 2024-03-11 PDBE 
A1H52 "Initial release"  2024-04-03 RCSB 
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